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Étude historique de la visualisation des protéines: De la repsentation ancienne de « noyau organique azoté » du XIX<sup>esup> siècle à la vision statique en « boules-tiges de fer » des années cinquante aux méthodes actuelles de modélisationen dynamique moléculaire
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文摘
L&rsquo;histoire de la visualisation des prot&eacute;ines est ins&eacute;parable de celle de la biologie structurale qui &eacute;tudie la structure et l&rsquo;organisation spatiale des macromol&eacute;cules biologiques. Les anciens avaient initialement imagin&eacute; les prot&eacute;ines comme des noyaux organiques azot&eacute;s entour&eacute;s d&rsquo;une copule min&eacute;rale. La d&eacute;termination à l&rsquo;&eacute;chelle atomique de la structure 3D des prot&eacute;ines fait appel à des techniques d&rsquo;approche biophysiques &eacute;labor&eacute;es dans la première moiti&eacute; du vingtième siècle. La cristallographie par diffraction des rayons X permet d&rsquo;obtenir une carte de densit&eacute; &eacute;lectronique. La spectroscopie par r&eacute;sonance magn&eacute;tique nucl&eacute;aire (RMN) d&eacute;finit une carte des distances inter-protons et des angles de torsion du squelette de la prot&eacute;ine. La cryomicroscopie &eacute;lectronique donne une image directe de la mol&eacute;cule saisie dans son milieu aqueux. Ces trois familles de techniques &eacute;voluent de manière spectaculaire pour grandir en pr&eacute;cision, en d&eacute;finition et en analyse spatiale et temporelle. Aujourd&rsquo;hui ces m&eacute;thodes convergent grâce à des bases de donn&eacute;es interactives et des outils bioinformatiques de mod&eacute;lisation dynamique vers la d&eacute;finition de modèles de liaisons « prot&eacute;ines-ligands », la d&eacute;couverte d&rsquo;inhibiteurs pharmacologiques, la pr&eacute;diction de structure macromol&eacute;culaire et une compr&eacute;hension accrue des maladies du repliement anormal des prot&eacute;ines.

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