Varón de 2 años de edad con síndrome de intestino corto, malnutrición severa y raquitismo hipofosfatémico carencial, que ingresó en la unidad de cuidados intensivos pediátricos por una infección respiratoria de vías bajas y sospecha de pseudoobstrucción intestinal. Precisó varios ciclos de antibioterapia de amplio espectro por infecciones por Pseudomonas aeruginosa y Escherichia coli. Tras la corrección quirúrgica de su patología intestinal comenzó con un nuevo episodio de sepsis, del que se aislaron levaduras por cultivo. La identificación se realizó mediante espectrometría de masas por el sistema MALDI-TOF (Bruker Daltonic). El resultado obtenido fue el de C. fabianii (anamorfo)/Pichia fabianii (teleomorfo), con un score de 2,149. Se inició un tratamiento antifúngico con caspofungina, con buena evolución del paciente.
Es importante realizar técnicas de biología molecular para la identificación de este tipo de especies, aunque la espectrometría de masas ofreció un diagnóstico fiable y rápido. El tratamiento con caspofungina fue eficaz.