Une exploration du gxe9;nome par puce xe0; ADN (Human1M-Duo) a xe9;txe9; conduite chez 9 familles, dont 3 consanguines, permettant de dxe9;tecter de grandes rxe9;gions homozygotes (1Mb) chez les cas index avec MDI. Une stratxe9;gie de sxe9;quenxe7;age exomique global (20,000 CCDS-ID) est entreprise chez 20 patients avec MDI et 8 familles MODY-X. Deux protocoles de capture d’exons sont testxe9;s, par longs oligonuclxe9;otides sur puce (NimbleGen 2.1M array) ou par enrichissement de sxe9;quences en phase liquide (Agilent SureSelect-Human-AII). Chaque librairie exomique individuelle est soumise xe0; un sxe9;quenxe7;age trxe8;s haut dxe9;bit (Roche-GS-FLX ou Illumina-GAII) d’une profondeur 20x au moins. Les variants non rxe9;pertorixe9;s, rares ou uniques, identifixe9;s par filtres informatiques seront validxe9;s par sxe9;quenxe7;age direct Sanger.
À ce jour, 52 % des patients MDI diagnostiquxe9;s entre 1mois-3 ans (incluant des formes rares avec agxe9;nxe9;sie/hypoplasie du pancrxe9;as ou syndromiques avec anomalies extra-pancrxe9;atiques), 27 % des formes transitoires et 26 % des formes MODY de notre cohorte sont non xe9;lucidxe9;s. L’analyse des donnxe9;es gxe9;notypiques au sein des familles montre des rxe9;gions d’homozygotie partagxe9;es entre familles (chr1, 8, 10, 15) ou spxe9;cifiques ; d’autres remaniements chromosomiques sont xe9;tudixe9;s. Ces rxe9;sultats seront intxe9;grxe9;s aux donnxe9;es du sxe9;quenxe7;age et les mutations identifixe9;es, recherchxe9;es au sein d’autres cohortes europxe9;ennes dans le cadre d’un consortium transnational.
La dxe9;couverte de nouvelles xe9;tiologies gxe9;nxe9;tiques dans ces dysfonctions pancrxe9;atiques permettra une meilleure classification des diabxe8;tes chez l’enfant, un conseil gxe9;nxe9;tique et un suivi personnalisxe9; sur une base pharmaco- gxe9;nomique ; ainsi que de mieux comprendre la physiopathologie des cellules ®.