En utilisant des puces xe0; ADN Illumina, nous avons analysxe9; l’expression d’environ 20,000 gxe8;nes dans le tissu adipeux blanc d’une population F2 (n = 138) derivxe9;e du GK et du rat contrôle Brown-Norway (BN) et d’une lignxe9;e congxe9;nique portant sur un fond gxe9;nxe9;tique BN, les allxe8;les GK xe0; un locus gxe9;netique (QTL) lixe9; xe0; l’adipositxe9;. Les loci lixe9;s xe0; l’expression des gxe8;nes (eQTL) ont xe9;txe9; identifixe9;s dans la population F2 en utilisant R/QTL, validxe9;s dans la lignxe9;e congxe9;nique par qRT-PCR, et analysxe9;s en relation avec la sxe9;quence gxe9;nomique du GK produite au laboratoire.
Nous avons identifixe9; sur le gxe9;nome entier, 585 eQTLs statistiquement significatifs (LOD > 9). La rxe9;gion 1q33 (8,3Mb), qui cosxe9;grxe8;ge avec un QTL d’adipositxe9;, contient 172 gxe8;nes candidats positionnels, parmi lesquels 44 correspondent xe0; un eQTL. Nous avons validxe9; l’expression diffxe9;rentielle de 27 de ces 44 gxe8;nes dans la lignxe9;e congxe9;nique, qui montrent pour 48 % d’entre eux un effet de rxe9;gulation transcriptionnelle en cis. L’analyse de 20,000 polymorphismes SNPs prxe9;sents dans la rxe9;gion 1q33 nous a permis d’xe9;liminer les eQTLs faux positifs et d’entreprendre l’analyse fonctionnelle de polymorphismes localisxe9;s sur les gxe8;nes candidats positionnels du QTL lixe9; xe0; l’adipositxe9;, parmi lesquels le facteur de transcription ASCL3 (LOD > 43).
L’utilisation combinxe9;e de donnxe9;es du transcriptome et de sxe9;quenxe7;age nous a permis d’xe9;lucider le contrôle transcriptionnel du tissu adipeux blanc chez un modxe8;le de diabxe8;te et d’identifier des gxe8;nes candidats fonctionnels et positionnels au locus1q33 associxe9; xe0; l’adipositxe9; chez le rat GK. P