In Vivo Cleavage Map Illuminates the Central Role of RNase E in Coding and Non-coding RNA Pathways

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• 作者：Yanjie Chao<sup>1sup> ; Lei Li<sup>1sup><sup> ; sup><sup>2sup> ; Dylan Girodat<sup>3sup> ; Konrad U. Fö ; rstner<sup>1sup><sup> ; sup><sup>2sup> ; Nelly Said<sup>4sup> ; Colin Corcoran<sup>1sup> ; Michał Śmiga<sup>1sup> ; Kai Papenfort<sup>1sup><sup> ; sup><sup>5sup> ; Richard Reinhardt<sup>6sup> ; Hans-Joachim Wieden<sup>3sup> ; Ben F. Luisi<sup>7sup> ; Jö ; rg Vogel<sup>1sup><sup> ; sup><sup>8sup><sup> ; sup><sup>9sup><sup> ; sup><sup>joerg.vogel@uni-wuerzburg.desup>
• 关键词：RNase E ; RNA degradome ; non-coding RNA ; Hfq ; 3&prime ; UTR ; ArcZ ; RprA ; sRNA maturation ; uridine ruler ; TIER-seq
• 刊名：Molecular Cell
• 出版年：2017
• 出版时间：5 January 2017
• 年：2017
• 卷：65
• 期：1
• 页码：39-51
• 全文大小：3292 K
• 卷排序：65

文摘

TIER-seq precisely maps ∼22,000 endogenous RNase E cleavage sites in Salmonella Consensus motif of RNase E reveals a 2-nt uridine ruler-and-cut mechanism RNase E is a central component in both maturation and degradation of small RNAs There is a general small-RNA biogenesis pathway requiring RNase E and Hfq