作者：Kecheng Zhu^a ; Na Wu^a ; Xiaoxiao Sun^a ; Huayang Guo^a ; Nan Zhang^a ; Shigui Jiang^a ; ^b ; Dianchang Zhang^a ; ^{zhangdch@scsfri.ac.cn}

关键词：ATP6 and ATP8 ; ATPase subunits 6 and 8 ; COXI&ndash ; COXIII ; cytochrome c oxidase subunits I&ndash ; III ; Cytb ; apocytochrome b ; ND1&ndash ; ND6 and ND4L ; NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4L ; rrnL ; lrRNA ; large (16S) rRNA subunit (gene) ; rrnS ; srRNA ; small (12S) rRNA subunit (gene) ; rRNA ; ribosomal RNA ; PCGs ; protein-coding genes ; tRNA ; transfer RNA ; D-loop region ; a major non-coding control region ; MP ; Maximum parsimony ; ML ; Maximum likelihood ; BI ; Bayesian inference

刊名：Gene

出版年：2017

作者：Xincong Kang^a ; ^b ; ^c ; Yongquan Hu^b ; ^c ; Jiang Hu^d ; Liqin Hu^b ; ^c ; Feng Wang^d ; Dongbo Liu^a ; ^b ; ^c ; ^{chinasaga@163.com}

关键词：PCGs ; protein-coding genes ; A ; adenine ; T ; thymine ; G ; guanine ; C ; cytosine ; atp6 & atp8 ; genes for the ATPase subunits 6 and 8 ; cox1-cox3 ; genes for cytochrome C oxidase subunits I&ndash ; III ; nad1&ndash ; nad6 and nad4L ; genes for NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4L ; rrnL ; large (16S) rRNA subunit ; rrnS ; small (12S) rRNA subunit ; trnX ; transfer RNA ; where X is replaced by one letter amino acid code of the corresponding amino acid ; ML ; maximum likelihood ; K2P ; Kimura's two parameter

刊名：Gene

出版年：2017

作者：Victor Corrê ; a Seixas^a ; ^{victorcseixas@gmail.com} ; Claudia Augusta de Moraes Russo^a ; Paulo Cesar Paiva^b

关键词：ATP6 and ATP8 ; ATPase subunits 6 and 8 ; bp ; base pairs ; CO1 &ndash ; CO3 ; Cytochrome c oxidase subunits I-III ; ND1 &ndash ; ND6 and ND4L ; NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4L ; rRNA ; ribosomal RNA ; TDRL ; tandem-duplication-random-loss ; tRNA ; transfer RNA

刊名：Gene

出版年：2017

作者：Genki Ozawa^a ; ^b ; ^{genki-ozawa@jamstec.go.jp} ; Shigeru Shimamura^b ; ^{shimas@jamstec.go.jp} ; Yoshihiro Takaki^b ; ^{takakiy@jamstec.go.jp} ; Shin-ichi Yokobori^c ; ^{yokobori@ls.toyaku.ac.jp} ; Yasuhiko Ohara^d ; ^{ohara@jodc.go.jp} ; Kiyotaka Takishita^b ; ^{takishitak@jamstec.go.jp} ; Tadashi Maruyama^b ; ^{tadashim@jamstec.go.jp} ; Katsunori Fujikura^b ; ^{fujikura@jamstec.go.jp} ; Takao Yoshida^a ; ^b ; ^{tyoshida@jamstec.go.jp}

关键词：A  ; + T ; adenosine and thymidine ; atp6 and 8 ; ATP synthase Fo subunit 6 and 8 ; bp ; base pairs ; BP ; bootstrap probability ; cob ; cytochrome b ; cox1&ndash3 ; cytochrome c oxidase subunits I-III ; dNTPs ; deoxynucleotides ; L1 ; tRNALeu1 (anticodon ; UAA) ; L2 ; tRNALeu2 (anticodon ; UAG) ; ML ; maximum likelihood ; nad1&ndash ; 6 and nad4L ; NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4L ; NCR ; non-coding region ; PCR ; polymerase chain reaction ; PP ; posterior probability ; rrnL and rrnS ; large and small subun

刊名：Marine Genomics

出版年：2017

作者：Aijiang Guo^a ; ^b ; ^{guoaijiang@caas.cn}

关键词：mt ; mitochondrial ; nad1-6 ; NADH dehydrogenase subunit 1&ndash6 ; cox1-3 ; cytochrome c oxidase subunit 1&ndash3 ; cytb ; cytochrome b ; atp6 ; ATPase subunit 6 ; trn ; transfer RNA ; rrnL ; large subunit ribosomal RNA ; rrnS ; small subunit ribosomal RNA ; Mb ; Moniezia benedeni ; Me ; M. expansa ; Am ; Anoplocephala magna ; Ap ; Anoplocephala perfoliata

刊名：Acta Tropica

出版年：2017

作者：Thorsten Friedrich^a ; ^b ; ^{Friedrich@bio.chemie.uni-freiburg.de" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Doris Kreuzer Dekovic^a ; ^b ; Sabrina Burschel^a

关键词：Escherichia coli ; Complex I ; NADH dehydrogenase ; NADH ; ubiquinone oxidoreductase ; Assembly ; Iron&ndash ; sulfur cluster

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

出版年：2016

作者：Chao Du^a ; Shilin He^a ; Xuhao Song^a ; Qi Liao^b ; Xiuyue Zhang^a ; Bisong Yue^a ; ^{bsyue@scu.edu.cn" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：PCGs ; protein-coding genes ; ATP8 and ATP6 ; ATPase subunits 8 and 6 ; COX1&ndash ; COX3 ; cytochrome C oxidase subunit I&ndash ; III ; CytB ; cytochrome b ; ND1&ndash ; ND6 and ND4L ; NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4 L ; lrRNA ; large (16S) rRNA subunit ; srRNA ; small (12S) rRNA subunit ; BI ; Bayesian inference ; ML ; maximum likelihood ; BPP ; Bayesian posterior probabilities ; BS ; bootstrap supports

刊名：Gene

出版年：2016

作者：Qiqi Wang ; Zhengqing Zhang ; Guanghui Tang ; ^{tanggh@nwsuaf.edu.cn" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：PCGs ; protein-coding genes ; atp6 and atp8 ; genes for the ATPase subunits 6 and 8 ; cox1&ndash ; cox3 ; genes for cytochrome C oxidase subunits I&ndash ; III ; nad1&ndash ; nad6 and nad4l ; genes for NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4l ; rrnL ; large (16S) rRNA subunit (gene) ; rrnS ; small (12S) rRNA subunit (gene) ; trnX ; (where X is replaced by one letter amino acid code of the corresponding amino acid) ; transfer RNA

刊名：Gene

出版年：2016

作者：K.C.C. Capel^a ; A.E. Migotto^b ; C. Zilberberg^a ; M.F. Lin^c ; ^d ; ^e ; Z. Forsman^f ; D.J. Miller^c ; ^e ; M.V. Kitahara^b ; ^g ; ^{mvkitahara@unifesp.br" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：A ; adenine ; aa ; amino acid(s) ; ATP6 ; ATP synthase F0 subunit 6 ; ATP8 ; ATP synthase F0 subunit 8 ; bp ; base pair(s) ; C ; cytosine ; COB ; cytochrome b ; COX1&ndash3 ; cytochrome oxidase subunit 1&ndash3 ; G ; guanine ; IGS ; intergenic spacer ; indel ; insertion or deletion ; ITS ; internal transcribed spacer ; Kb ; kilobase ; m ; meter ; min ; minute ; mt ; mitochondrial ; ND1&ndash5 ; NADH dehydrogenase subunits 1&ndash5 ; ND4L ; NADH dehydrogenase subunit 4L ; nt ; nucleotide(s) ; rnl ; 16S ribosomal RNA ; rns ; 12S ribo

刊名：Gene

出版年：2016

作者：M. Teresa Aguado^a ; ^{maite.aguado@uam.es" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Cristina Grande^b ; Michael Gerth^c ; Christoph Bleidorn^c ; Carolina Noreñ ; a^d

关键词：atp6 and 8 ; ATPase subunits 6 and 8 ; bp ; base pair(s) ; cob ; cytochrome b ; cox1&ndash3 ; cytochrome c oxidase subunits I&ndash ; III ; kb ; kilo base ; LBA ; long branch attraction effect ; mt genomes ; mitochondrial genomes ; ML ; maximum likelihood ; mtDNA ; mitochondrial DNA ; nad1&ndash ; 6 and 4L ; NADH dehydrogenase subunits 1&ndash ; 6 and 4L ; NCBI ; National Centre for Biotechnology Information ; rRNA ; ribosomal RNA ; rrnS and rrnL ; small and large subunits ribosomal RNA ; Sp ; species ; Tdrl ; tandem-duplication

刊名：Gene

出版年：2016