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1.Transposable element influences on gene expression in plants

作者：Cory D. Hirsch^a ; Nathan M. Springer^b ; ^{springer@umn.edu}

关键词：Transposable element ; gene expression ; chromatin modifications

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

2.TRIM28 Controls a Gene Regulatory Network Based on Endogenous Retroviruses in Human Neural Progenitor Cells

作者：Per Ludvik Brattå ; s¹ ; Marie E. Jö ; nsson¹ ; Liana Fasching¹ ; Jenny Nelander Wahlestedt⁴ ; Mansoureh Shahsavani² ; Ronny Falk² ; Anna Falk² ; Patric Jern³ ; Malin Parmar⁴ ; Johan Jakobsson¹ ; ⁵ ; ^{johan.jakobsson@med.lu.se}

关键词：human development ; transposable elements ; epigenetics ; neural stem cells ; gene regulation

刊名：Cell Reports

出版年：2017

3.Sequencing and comparative analyses of Aegilops tauschii chromosome arm 3DS reveal rapid evolution of Triticeae genomes

作者：Jingzhong Xie^a ; ¹ ; Naxin Huo^b ; ^c ; ¹ ; Shenghui Zhou^a ; ¹ ; Yi Wang^b ; ¹ ; Guanghao Guo^a ; Karin R. Deal^c ; Shuhong Ouyang^a ; Yong Liang^a ; Zhenzhong Wang^a ; Lichan Xiao^c ; Tingting Zhu^c ; Tiezhu Hu^b ; Vijay Tiwari^d ; Jianwei Zhang^e ; Hongxia Li^b ; Zhongfu Ni^a ; Yingyin Yao^a ; Huiru Peng^a ; Shengli Zhang^b ; Olin D. Anderson^b ; Patrick E. McGuire^c ; Jan Dvorak^c ; ^{jdvorak@ucdavis.edu} ; Ming-Cheng Luo^c ; ^{mcluo@ucdavis.edu} ; Zhiyong Liu^a ; ^{zyliu@genetics.ac.cn} ; Yong Q. Gu^b ; ^{yong.gu@ars.usda.gov} ; Qixin Sun^a ; ^{qxsun@cau.edu.cn}

关键词：Aegilops tauschii ; Genome sequencing ; Sequence assembly ; Comparative genomics ; Grass evolution

刊名：Journal of Genetics and Genomics

出版年：2017

4.Real Time Study of Transposable Element Activity

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

5.Massive contribution of transposable elements to mammalian regulatory sequences

作者：Nirmala Arul Rayan^a ; ¹ ; Ricardo C.H. del Rosario^b ; ¹ ; Shyam Prabhakar^a ; ^{prabhakars@gis.a-star.edu.sg" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Transposons ; Regulatory elements ; Primate-specific ; Transposable element functionalization

刊名：Seminars in Cell & Developmental Biology

出版年：2016

6.Horizontal transfers of transposable elements in eukaryotes: The flying genes

作者：Olivier Panaud¹ ; ^{panaud@univ-perp.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Transposable elements ; Horizontal transfers ; Eukaryotes ; Parasitism ; Genomics

刊名：Comptes Rendus Biologies

出版年：2016

7.DNA Damage-Induced Transcription of Transposable Elements and Long Non-coding RNAs in Arabidopsis Is Rare and ATM-Dependent

作者：Zhenxing Wang¹ ; Rainer Schwacke² ; Reinhard Kunze¹ ; ^{reinhard.kunze@fu-berlin.de" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Arabidopsis thaliana ; ataxia telangiectasia mutated ; DNA damage response ; transposable element ; long non-coding RNA

刊名：Molecular Plant

出版年：2016

8.Holliday Junctions Are Associated with Transposable Element Sequences in the Human Genome

作者：Paris Ladias¹ ; Georgios Markopoulos² ; Leandros Lazaros¹ ; Sofia Markoula³ ; Theodore Tzavaras² ; Ioannis Georgiou¹ ; ^{igeorgio@uoi.gr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：HJ ; Holliday junction ; TE ; transposable elements ; NHR ; non-homologous recombination

刊名：Journal of Molecular Biology

出版年：2016

9.Densely ionizing radiation affects DNA methylation of selective LINE-1 elements

作者：Sara Prior^a ; ¹ ; Isabelle R. Miousse^a ; ¹ ; Etienne Nzabarushimana^a ; ^b ; Rupak Pathak^c ; Charles Skinner^a ; Kristy R. Kutanzi^a ; Antiñ ; o R. Allen^c ; Jacob Raber^d ; Alan J. Tackett^e ; Martin Hauer-Jensen^c ; Gregory A. Nelson^f ; Igor Koturbash^a ; ^{ikoturbash@uams.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：Gy ; Gray ; IR ; ionizing radiation ; LET ; Linear Energy Transfer ; LINE-1 ; Long Interspersed Nucleotide Element 1 ; MDD ; methionine-deficient diet ; MAD ; methionine-adequate diet ; MDD ; methionine-deficient diet ; MeV ; Megaelectron volt ; Myr ; million years ; ORF ; open reading frame ; qRT-PCR ; Quantitative Real Time Polymerase Chain Reaction ; SPE ; Solar Particle Events ; TE ; transposable elements ; UTR ; untranslated region

刊名：Environmental Research

出版年：2016

10.Fractality and entropic scaling in the chromosomal distribution of conserved noncoding elements in the human genome

作者：Dimitris Polychronopoulos^a ; ¹ ; Labrini Athanasopoulou^b ; Yannis Almirantis^a ; ^{yalmir@bio.demokritos.gr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：CNEs ; conserved noncoding elements ; E ; extent of linearity in semi-logarithmic scale ; FrL ; Fractality-related Linearity ; GRBs ; Genomic Regulatory Blocks ; PCSs ; Protein Coding Segments ; SD ; segmental duplication ; TEs ; Transposable Elements ; UCEs ; UCNEs ; ultraconserved elements

刊名：Gene

出版年：2016

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