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1. Absolute binding free energies for octa-acids and guests in SAMPL5

作者： Florentina Tofoleanu ; Juyong Lee…

关键词：Binding free energy simulations ; Thermodynamic integration ; Hamiltonian replica exchange ; Bennett acceptance ratio ; Double decoupling method ; Molecular dynamics simulations ; GalaxyDock ; HG

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

2. Absolute binding free energy calculations of CBClip host–guest systems in the SAMPL5 blind challenge

作者： Juyong Lee ; Florentina Tofoleanu…

关键词：Absolute binding free energy calculation ; Hamiltonian replica exchange ; Thermodynamic integration ; Bennett’s acceptance ratio ; Double decoupling scheme ; Host ; guest complexes ; Constant ; pH simulation

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2017

3. Numerical Considerations for Lagrangian Stochastic Dispersion Models: Eliminating Rogue Trajectories, and the Importance of Numerical Accuracy

作者： Brian N. Bailey

关键词：Lagrangian stochastic dispersion models ; Large ; eddy simulation ; Rogue trajectories ; Turbulent dispersion

刊名：Boundary-Layer Meteorology

出版年：2017

4. A relaxation-based approach to damage modeling

作者： Philipp Junker ; Stephan Schwarz ; Jerzy Makowski…

刊名：Continuum Mechanics and Thermodynamics

出版年：2017

5. Determination of the protonation state of the Asp dyad: conventional molecular dynamics versus thermodynamic integration

作者： Jinfeng Huang ; Yali Zhu ; Bin Sun ; Yuan Yao ; Junjun Liu

关键词：Asp dyad ; Protonation state ; BACE1 ; Molecular dynamics ; Thermodynamic integration

刊名：Journal of Molecular Modeling

出版年：2016

6. Thermodynamic analyses and optimization for thermoelectric devices: The state of the arts

作者： LinGen Chen ; FanKai Meng ; FengRui Sun

关键词：thermoelectrics ; power generation ; refrigeration ; heat pumping ; non ; equilibrium thermodynamics ; finite time thermodynamics

刊名：SCIENCE CHINA Technological Sciences

出版年：2016

7. The Principle of Minimal Resistance in Non-equilibrium Thermodynamics

作者： Roberto Mauri

关键词：Principle of minimal resistance ; Hamiltonian density time rate ; Non ; equilibrium thermodynamics ; Path integration

刊名：Foundations of Physics

出版年：2016

8. Efficiency analysis of trilateral-cycle power systems for waste heat recovery-to-power generation

作者： Habeeb A. Ajimotokan

关键词：Key wordstrilateral cycle ; waste heat recovery ; to ; power generation ; thermodynamic performance simulation ; efficiency analysis ; process development and integration

刊名：Journal of Central South University

出版年：2016

9. Evaluation of the energy saving opportunities for palm oil refining process: Sahabat Oil Products (SOP) in Lahad Datu, Malaysia

作者： Seri Rahimah Lidu ; Nurul‘Ain Mohamed…

关键词：Refined bleached deodorised palm oil ; Heat integration ; Pinch analysis ; Composite curves ; Environmental footprints reduction ; Shifted retrofit thermodynamic grid diagram

刊名：Clean Technologies and Environmental Policy

出版年：2016

10. Prediction of cyclohexane-water distribution coefficients for the SAMPL5 data set using molecular dynamics simulations with the OPLS-AA force field

作者： Ian M. Kenney ; Oliver Beckstein…

关键词：Molecular dynamics ; Solvation free energy ; OPLS ; AA force field ; Ligand parameterization ; Free energy perturbation ; Thermodynamic integration ; Cyclohexane ; water distribution coefficients

刊名：Journal of Computer-Aided Molecular Design

出版年：2016

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