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SpringerLink电子期刊(22)

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1. Kisspeptin Induces Dynamic Chromatin Modifications to Control GnRH Gene Expression

作者： H. J. Novaira ; M. L. Sonko ; S. Radovick

刊名：Molecular Neurobiology

出版年：2016

2. Identifying multi-locus chromatin contacts in human cells using tethered multiple 3C

作者：Ferhat Ay (1)
Thanh H Vu (2)
Michael J Zeitz (2)
Nelle Varoquaux (3) (4) (5)
Jan E Carette (6)
Jean-Philippe Vert (3) (4) (5)
Andrew R Hoffman (2)
William S Noble (1) (7)

1. Department of Genome Sciences ; University of Washington ; Seattle ; 98195 ; WA ; USA
2. Veterans Affairs Palo Alto Health Care System ; Stanford University Medical School ; Palo Alto ; 94304 ; CA ; USA
3. Mines ParisTech ; PSL-Research University ; CBIO-Centre for Computational Biology ; 35 rue St Honor茅 ; Fontainebleau ; 77300 ; France
4. Institut Curie ; Paris ; F-75248 ; France
5. U900 ; INSERM ; ParisF-75248 ; France
6. Department of Microbiology and Immunology ; Stanford University ; Stanford ; 94305 ; CA ; USA
7. Department of Computer Science and Engineering ; University of Washington ; Seattle ; 98195 ; WA ; USA

关键词：Genome architecture ; Chromatin conformation capture ; Multi ; locus chromatin contacts ; Near ; haploid human cells ; Leukemia ; Three ; dimensional modeling

刊名：BMC Genomics

出版年：2015

3. NuChart-II: A Graph-Based Approach for Analysis and Interpretation of Hi-C Data

关键词：Systems Biology ; Parallel Computing ; Hi ; C data ; Neighbourhood Graph ; Chromosome Conformation Capture

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2015

4. HiCdat: a fast and easy-to-use Hi-C data analysis tool

作者： Marc W. Schmid ; Stefan Grob ; Ueli Grossniklaus

关键词：Chromosome Conformation Capture (3C) ; Nuclear architecture ; HiC ; Data analysis ; Sample comparison ; Structural domains ; Correlation to (epi ; )genome

刊名：BMC Bioinformatics

出版年：2015

5. Inferring 3D chromatin structure using a multiscale approach based on quaternions

作者： Claudia Caudai ; Emanuele Salerno ; Monica Zoppè ; Anna Tonazzini

关键词：3d ; chromatin structure ; Chromosome conformation capture ; Multiscale approach ; Quaternions

刊名：BMC Bioinformatics

出版年：2015

6. A novel method to identify topological domains using Hi-C data

作者： Yang Wang ; Yanjian Li ; Juntao Gao ; Michael Q. Zhang

关键词：chromatin domain ; HiC ; dynamic programming

刊名：Quantitative Biology

出版年：2015

7. Targeted Chromatin Capture (T2C): a novel high resolution high throughput method to detect genomic interactions and regulatory elements

作者： Petros Kolovos ; Harmen JG van de Werken ; Nick Kepper…

关键词：Chromatin conformation capture ; Long range interactions ; Enhancers ; Promoters

刊名：Epigenetics & Chromatin

出版年：2014

8. Genome-wide replication landscape of Candida glabrata

作者： Stéphane Descorps-Declère ; Cyril Saguez ; Axel Cournac ; Martial Marbouty…

关键词：3C ; ACS ; ARS ; Candida glabrata ; Chromosome organization ; Megasatellites ; Replication ; Yeast

刊名：BMC Biology

出版年：2015

9. Deconvolution of Ensemble Chromatin Interaction Data Reveals the Latent Mixing Structures in Cell Subpopulations

刊名：Lecture Notes in Computer Science

出版年：2015

10. Filling the gap: Micro-C accesses the nucleosomal fiber at 100᾿000 bp resolution

作者： Julien Mozziconacci ; Romain Koszul

刊名：Genome Biology

出版年：2015

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