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1. Computational evaluation of glutamine synthetase as drug target against infectious diseases: molecular modeling, substrate-binding analysis, and molecular dynamics simulation studies

作者： Nidhi Singh ; Mohammad Imran Siddiqi

关键词：Glutamine synthetase ; Homology modeling ; Molecular dynamics simulations ; Binding site identification ; Structure ; guided drug design ; Infectious diseases

刊名：Medicinal Chemistry Research

出版年：2017

2. NMR study of the effects of some bleomycin C-termini on the structure of a DNA hairpin with the 5′-GC-3′ binding site

作者： Teresa E. Lehmann ; Sally A. Murray…

关键词：DNA ; NMR ; Structure–function ; Anticancer drug ; Pulmonary fibrosis

刊名：JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry

出版年：2017

3. The crystal structure of the AgamOBP1•Icaridin complex reveals alternative binding modes and stereo-selective repellent recognition

作者： Christina E. Drakou ; Katerina E. Tsitsanou…

关键词：Anopheles gambiae ; Odorant binding protein ; Repellents ; Icaridin ; DEET ; Stereoselectivity

刊名：Cellular and Molecular Life Sciences

出版年：2017

4. Computational identification of novel entry inhibitor scaffolds mimicking primary receptor CD4 of HIV-1 gp120

作者： Alexander M. Andrianov ; Ivan A. Kashyn…

关键词：Cellular receptor CD4 ; HIV ; 1 gp120 protein ; Molecular docking ; Molecular dynamics ; Peptidomimetics ; Small molecule CD4 ; antagonists ; Virtual screening

刊名：Journal of Molecular Modeling

出版年：2017

5. Identification of potential glutaminyl cyclase inhibitors from lead-like libraries by in silico and in vitro fragment-based screening

作者： Mária Szaszkó ; István Hajdú ; Beáta Flachner ; Krisztina Dobi…

关键词：Fragment ; based screening ; Differential scanning fluorimetry ; Glutaminyl cyclase ; Fragment linking

刊名：Molecular Diversity

出版年：2017

6. Genome-wide analysis and characterization of molecular evolution of the HCT gene family in pear (Pyrus bretschneideri)

作者： Ce Ma ; Huping Zhang ; Jiaming Li ; Shutian Tao ; Xin Qiao…

关键词：Evolution ; Gene expression ; HCT gene family ; Lignin synthesis ; Pear

刊名：Plant Systematics and Evolution

出版年：2017

7. An approach of identifying differential nucleosome regions in multiple samples

作者： Lingjie Liu ; Jianming Xie ; Xiao Sun ; Kun Luo ; Zhaohui Steve Qin ; Hongde Liu

关键词：Nucleosome ; Multiple cell types ; Differential nucleosome regions (DNRs) ; Chi ; squared test

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

8. The orientation of transcription factor binding site motifs in gene promoter regions: does it matter?

作者： Monika Lis ; Dirk Walther

关键词：Cis ; regulatory elements ; Transcription factors ; Transcription factor binding sites ; Motifs ; Gene expression

刊名：BMC Genomics

出版年：2016

9. Identification of catalysis, substrate, and coenzyme binding sites and improvement catalytic efficiency of formate dehydrogenase from Candida boidinii

作者： Wei Jiang ; Peng Lin ; Ruonan Yang ; Baishan Fang

关键词：Biocatalyst ; Molecular modeling ; Biocatalysis ; Chiral compounds ; Cofactor regeneration

刊名：Applied Microbiology and Biotechnology

出版年：2016

10. Computational Analysis and Binding Site Identification of Type III Secretion System ATPase from Pseudomonas aeruginosa

作者： Raju Dash ; S. M. Zahid Hosen…

关键词：ATPase ; Pseudomonas aeruginosa ; Type III secretion system ; Phylogenetic analysis ; Salicylidene acylhydrazide

刊名：Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences

出版年：2016

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