作者：Kyle J. Minch ; Tige R. Rustad ; Eliza J. R. Peterson ; Jessica Winkler ; David J. Reiss ; Shuyi Ma ; Mark Hickey ; William Brabant ; Bob Morrison ; Serdar Turkarslan ; Chris Mawhinney ; James E. Galagan ; Nathan D. Price ; Nitin S. Baliga ; David R. Sherman

关键词：Biological sciences ; Genetics ; Molecular biology

刊名：Nature Communications

出版年：2015

作者：James E. Galagan ; Kyle Minch ; Matthew Peterson ; Anna Lyubetskaya ; Elham Azizi ; Linsday Sweet ; Antonio Gomes ; Tige Rustad ; Gregory Dolganov ; Irina Glotova ; Thomas Abeel ; Chris Mahwinney ; Adam D. Kennedy ; René ; Allard ; William Brabant ; Andrew Krueger ; Suma Jaini ; Brent Honda ; Wen-Han Yu ; Mark J. Hickey ; Jeremy Zucker ; Christopher Garay ; Brian Weiner ; Peter Sisk ; Christian Stolte ; Jessica K. Winkler ; Yves Van de Peer ; Paul Iazzetti ; Diogo Camacho ; Jonathan Dreyfuss ; Yang Liu ; Anca Dorhoi ; Hans-Joachim Mollenkopf ; Paul Drogaris ; Julie Lamontagne ; Yiyong Zhou ; Julie Piquenot ; Sang Tae Park ; Sahadevan Raman ; Stefan H. E. Kaufmann ; Robert P. Mohney ; Daniel Chelsky ; D. Branch Moody ; David R. Sherman ; Gary K. Schoolnik

关键词：Bacterial genomics ; Systems biology ; Computational biology and bioinformatics ; Tuberculosis

刊名：Nature

出版年：2013

作者：James E. Galagan ; Kyle Minch ; Matthew Peterson ; Anna Lyubetskaya ; Elham Azizi ; Linsday Sweet ; Antonio Gomes ; Tige Rustad ; Gregory Dolganov ; Irina Glotova ; Thomas Abeel ; Chris Mahwinney ; Adam D. Kennedy ; René ; Allard ; William Brabant ; Andrew Krueger ; Suma Jaini ; Brent Honda ; Wen-Han Yu ; Mark J. Hickey ; Jeremy Zucker ; Christopher Garay ; Brian Weiner ; Peter Sisk ; Christian Stolte ; Jessica K. Winkler ; Yves Van de Peer ; Paul Iazzetti ; Diogo Camacho ; Jonathan Dreyfuss ; Yang Liu ; Anca Dorhoi ; Hans-Joachim Mollenkopf ; Paul Drogaris ; Julie Lamontagne ; Yiyong Zhou ; Julie Piquenot ; Sang Tae Park ; Sahadevan Raman ; Stefan H. E. Kaufmann ; Robert P. Mohney ; Daniel Chelsky ; D. Branch Moody ; David R. Sherman ; Gary K. Schoolnik

关键词：Bacterial genomics ; Systems biology ; Computational biology and bioinformatics ; Tuberculosis

刊名：Nature

出版年：2013

作者：Li-Jun Ma ; H. Charlotte van der Does ; Katherine A. Borkovich ; Jeffrey J. Coleman ; Marie-José ; e Daboussi ; Antonio Di Pietro ; Marie Dufresne ; Michael Freitag ; Manfred Grabherr ; Bernard Henrissat ; Petra M. Houterman ; Seogchan Kang ; Won-Bo Shim ; Charles Woloshuk ; Xiaohui Xie ; Jin-Rong Xu ; John Antoniw ; Scott E. Baker ; Burton H. Bluhm ; Andrew Breakspear ; Daren W. Brown ; Robert A. E. Butchko ; Sinead Chapman ; Richard Coulson ; Pedro M. Coutinho ; Etienne G. J. Danchin ; Andrew Diener ; Liane R. Gale ; Donald M. Gardiner ; Stephen Goff ; Kim E. Hammond-Kosack ; Karen Hilburn ; Auré ; lie Hua-Van ; Wilfried Jonkers ; Kemal Kazan ; Chinnappa D. Kodira ; Michael Koehrsen ; Lokesh Kumar ; Yong-Hwan Lee ; Liande Li ; John M. Manners ; Diego Miranda-Saavedra ; Mala Mukherjee ; Gyungsoon Park ; Jongsun Park ; Sook-Young Park ; Robert H. Proctor ; Aviv Regev ; M. Carmen Ruiz-Roldan ; Divya Sain ; Sharadha Sakthikumar ; Sean Sykes ; David C. Schwartz ; B. Gillian Turgeon ; Ilan Wapinski ; Olen Yoder ; Sarah Young ; Qiandong Zeng ; Shiguo Zhou ; James Galagan ; Christina A. Cuomo ; H. Corby Kistler ; Martijn Rep

刊名：Nature

出版年：2010

作者：William C. Nierman ; Arnab Pain ; Michael J. Anderson ; Jennifer R. Wortman ; H. Stanley Kim ; Javier Arroyo ; Matthew Berriman ; Keietsu Abe ; David B. Archer ; Clara Bermejo ; Joan Bennett ; Paul Bowyer ; Dan Chen ; Matthew Collins ; Richard Coulsen ; Robert Davies ; Paul S. Dyer ; Mark Farman ; Nadia Fedorova ; Natalie Fedorova ; Tamara V. Feldblyum ; Reinhard Fischer ; Nigel Fosker ; Audrey Fraser ; Jose L. García ; Maria J. García ; Arlette Goble ; Gustavo H. Goldman ; Katsuya Gomi ; Sam Griffith-Jones ; Ryan Gwilliam ; Brian Haas ; Hubertus Haas ; David Harris ; H. Horiuchi ; Jiaqi Huang ; Sean Humphray ; Javier Jimé ; nez ; Nancy Keller ; Hoda Khouri ; Katsuhiko Kitamoto ; Tetsuo Kobayashi ; Sven Konzack ; Resham Kulkarni ; Toshitaka Kumagai ; Anne Lafon ; Jean-Paul Latgé ; Weixi Li ; Angela Lord ; Charles Lu ; William H. Majoros ; Gregory S. May ; Bruce L. Miller ; Yasmin Mohamoud ; Maria Molina ; Michel Monod ; Isabelle Mouyna ; Stephanie Mulligan ; Lee Murphy ; Susan O' ; Neil ; Ian Paulsen ; Miguel A. Peñ ; alva ; Mihaela Pertea ; Claire Price ; Bethan L. Pritchard ; Michael A. Quail ; Ester Rabbinowitsch ; Neil Rawlins ; Marie-Adele Rajandream ; Utz Reichard ; Hubert Renauld ; Geoffrey D. Robson ; Santiago Rodriguez de Có ; rdoba ; Jose M. Rodrí ; guez-Peña ; Catherine M. Ronning ; Simon Rutter ; Steven L. Salzberg ; Miguel Sanchez ; Juan C. Sá ; nchez-Ferrero ; David Saunders ; Kathy Seeger ; Rob Squares ; Steven Squares ; Michio Takeuchi ; Fredj Tekaia ; Geoffrey Turner ; Carlos R. Vazquez de Aldana ; Janice Weidman ; Owen White ; John Woodward ; Jae-Hyuk Yu ; Claire Fraser ; James E. Galagan ; Kiyoshi Asai ; Masayuki Machida ; Neil Hall ; Bart Barrell ; David W. Denning

刊名：Nature

出版年：2006

作者：Masayuki Machida ; Kiyoshi Asai ; Motoaki Sano ; Toshihiro Tanaka ; Toshitaka Kumagai ; Goro Terai ; Ken-Ichi Kusumoto ; Toshihide Arima ; Osamu Akita ; Yutaka Kashiwagi ; Keietsu Abe ; Katsuya Gomi ; Hiroyuki Horiuchi ; Katsuhiko Kitamoto ; Tetsuo Kobayashi ; Michio Takeuchi ; David W. Denning ; James E. Galagan ; William C. Nierman ; Jiujiang Yu ; David B. Archer ; Joan W. Bennett ; Deepak Bhatnagar ; Thomas E. Cleveland ; Natalie D. Fedorova ; Osamu Gotoh ; Hiroshi Horikawa ; Akira Hosoyama ; Masayuki Ichinomiya ; Rie Igarashi ; Kazuhiro Iwashita ; Praveen Rao Juvvadi ; Masashi Kato ; Yumiko Kato ; Taishin Kin ; Akira Kokubun ; Hiroshi Maeda ; Noriko Maeyama ; Jun-ichi Maruyama ; Hideki Nagasaki ; Tasuku Nakajima ; Ken Oda ; Kinya Okada ; Ian Paulsen ; Kazutoshi Sakamoto ; Toshihiko Sawano ; Mikio Takahashi ; Kumiko Takase ; Yasunobu Terabayashi ; Jennifer R. Wortman ; Osamu Yamada ; Youhei Yamagata ; Hideharu Anazawa ; Yoji Hata ; Yoshinao Koide ; Takashi Komori ; Yasuji Koyama ; Toshitaka Minetoki ; Sivasundaram Suharnan ; Akimitsu Tanaka ; Katsumi Isono ; Satoru Kuhara ; Naotake Ogasawaraand Hisashi Kikuchi

刊名：Nature

出版年：2005

作者：James E. Galagan ; Sarah E. Calvo ; Christina Cuomo ; Li-Jun Ma ; Jennifer R. Wortman ; Serafim Batzoglou ; Su-In Lee ; Meray Ba< ; img border=" ; 0" ; src=" ; /__chars/s/special/cedil/black/med/base/glyph.gif" ; align=" ; middle" ; /> ; tü ; rkmen ; Christina C. Spevak ; John Clutterbuck ; Vladimir Kapitonov ; Jerzy Jurka ; Claudio Scazzocchio ; Mark Farman ; Jonathan Butler ; Seth Purcell ; Steve Harris ; Gerhard H. Braus ; Oliver Draht ; Silke Busch ; Christophe D' ; Enfert ; Christiane Bouchier ; Gustavo H. Goldman ; Deborah Bell-Pedersen ; Sam Griffiths-Jones ; John H. Doonan ; Jaehyuk Yu ; Kay Vienken ; Arnab Pain ; Michael Freitag ; Eric U. Selker ; David B. Archer ; Miguel Á ; . Peñ ; alva ; Berl R. Oakley ; Michelle Momany ; Toshihiro Tanaka ; Toshitaka Kumagai ; Kiyoshi Asai ; Masayuki Machida ; William C. Nierman ; David W. Denning ; Mark Caddick ; Michael Hynes ; Mathieu Paoletti ; Reinhard Fischer ; Bruce Miller ; Paul Dyer ; Matthew S. Sachs ; Stephen A. Osmaniand Bruce W. Birren

刊名：Nature

出版年：2005

作者：William C. Nierman ; Arnab Pain ; Michael J. Anderson ; Jennifer R. Wortman ; H. Stanley Kim ; Javier Arroyo ; Matthew Berriman ; Keietsu Abe ; David B. Archer ; Clara Bermejo ; Joan Bennett ; Paul Bowyer ; Dan Chen ; Matthew Collins ; Richard Coulsen ; Robert Davies ; Paul S. Dyer ; Mark Farman ; Nadia Fedorova ; Natalie Fedorova ; Tamara V. Feldblyum ; Reinhard Fischer ; Nigel Fosker ; Audrey Fraser ; Jose L. García ; Maria J. García ; Arlette Goble ; Gustavo H. Goldman ; Katsuya Gomi ; Sam Griffith-Jones ; Ryan Gwilliam ; Brian Haas ; Hubertus Haas ; David Harris ; H. Horiuchi ; Jiaqi Huang ; Sean Humphray ; Javier Jimé ; nez ; Nancy Keller ; Hoda Khouri ; Katsuhiko Kitamoto ; Tetsuo Kobayashi ; Sven Konzack ; Resham Kulkarni ; Toshitaka Kumagai ; Anne Lafton ; Jean-Paul Latgé ; Weixi Li ; Angela Lord ; Charles Lu ; William H. Majoros ; Gregory S. May ; Bruce L. Miller ; Yasmin Mohamoud ; Maria Molina ; Michel Monod ; Isabelle Mouyna ; Stephanie Mulligan ; Lee Murphy ; Susan O' ; Neil ; Ian Paulsen ; Miguel A. Peñ ; alva ; Mihaela Pertea ; Claire Price ; Bethan L. Pritchard ; Michael A. Quail ; Ester Rabbinowitsch ; Neil Rawlins ; Marie-Adele Rajandream ; Utz Reichard ; Hubert Renauld ; Geoffrey D. Robson ; Santiago Rodriguez de Có ; rdoba ; Jose M. Rodrí ; guez-Peña ; Catherine M. Ronning ; Simon Rutter ; Steven L. Salzberg ; Miguel Sanchez ; Juan C. Sá ; nchez-Ferrero ; David Saunders ; Kathy Seeger ; Rob Squares ; Steven Squares ; Michio Takeuchi ; Fredj Tekaia ; Geoffrey Turner ; Carlos R. Vazquez de Aldana ; Janice Weidman ; Owen White ; John Woodward ; Jae-Hyuk Yu ; Claire Fraser ; James E. Galagan ; Kiyoshi Asai ; Masayuki Machida ; Neil Hall ; Bart Barrelland David W. Denning

刊名：Nature

出版年：2005

作者：James E. Galagan ; Sarah E. Calvo ; Katherine A. Borkovich ; Eric U. Selker ; Nick D. Read ; David Jaffe ; William FitzHugh ; Li-Jun Ma ; Serge Smirnov ; Seth Purcell ; Bushra Rehman ; Timothy Elkins ; Reinhard Engels ; Shunguang Wang ; Cydney B. Nielsen ; Jonathan Butler ; Matthew Endrizzi ; Dayong Qui ; Peter Ianakiev ; Deborah Bell-Pedersen ; Mary Anne Nelson ; Margaret Werner-Washburne ; Claude P. Selitrennikoff ; John A. Kinsey ; Edward L. Braun ; Alex Zelter ; Ulrich Schulte ; Gregory O. Kothe ; Gregory Jedd ; Werner Mewes ; Chuck Staben ; Edward Marcotte ; David Greenberg ; Alice Roy ; Karen Foley ; Jerome Naylor ; Nicole Stange-Thomann ; Robert Barrett ; Sante Gnerre ; Michael Kamal ; Manolis Kamvysselis ; Evan Mauceli ; Cord Bielke ; Stephen Rudd ; Dmitrij Frishman ; Svetlana Krystofova ; Carolyn Rasmussen ; Robert L. Metzenberg ; David D. Perkins ; Scott Kroken ; Carlo Cogoni ; Giuseppe Macino ; David Catcheside ; Weixi Li ; Robert J. Pratt ; Stephen A. Osmani ; Colin P. C. DeSouza ; Louise Glass ; Marc J. Orbach ; J. Andrew Berglund ; Rodger Voelker ; Oded Yarden ; Michael Plamann ; Stephan Seiler ; Jay Dunlap ; Alan Radford ; Rodolfo Aramayo ; Donald O. Natvig ; Lisa A. Alex ; Gertrud Mannhaupt ; Daniel J. Ebbole ; Michael Freitag ; Ian Paulsen ; Matthew S. Sachs ; Eric S. Lander ; Chad NusbaumandBruce Birren

刊名：Nature

出版年：2003

作者：International Human Genome Sequencing ConsortiumEric S. Lander ; Lauren M. Linton ; Bruce Birren ; Chad Nusbaum ; Michael C. Zody ; Jennifer Baldwin ; Keri Devon ; Ken Dewar ; Michael Doyle ; William FitzHugh ; Roel Funke ; Diane Gage ; Katrina Harris ; Andrew Heaford ; John Howland ; Lisa Kann ; Jessica Lehoczky ; Rosie LeVine ; Paul McEwan ; Kevin McKernan ; James Meldrim ; Jill P. Mesirov ; Cher Miranda ; William Morris ; Jerome Naylor ; Christina Raymond ; Mark Rosetti ; Ralph Santos ; Andrew Sheridan ; Carrie Sougnez ; Nicole Stange-Thomann ; Nikola Stojanovic ; Aravind Subramanian ; Dudley WymanforWhitehead Institute for Biomedical Research ; Center for Genome Research ; Jane Rogers ; John Sulston ; Rachael Ainscough ; Stephan Beck ; David Bentley ; John Burton ; Christopher Clee ; Nigel Carter ; Alan Coulson ; Rebecca Deadman ; Panos Deloukas ; Andrew Dunham ; Ian Dunham ; Richard Durbin ; Lisa French ; Darren Grafham ; Simon Gregory ; Tim Hubbard ; Sean Humphray ; Adrienne Hunt ; Matthew Jones ; Christine Lloyd ; Amanda McMurray ; Lucy Matthews ; Simon Mercer ; Sarah Milne ; James C. Mullikin ; Andrew Mungall ; Robert Plumb ; Mark Ross ; Ratna Shownkeen ; Sarah SimsforThe Sanger Centre ; Robert H. Waterston ; Richard K. Wilson ; LaDeana W. Hillier ; John D. McPherson ; Marco A. Marra ; Elaine R. Mardis ; Lucinda A. Fulton ; Asif T. Chinwalla ; Kymberlie H. Pepin ; Warren R. Gish ; Stephanie L. Chissoe ; Michael C. Wendl ; Kim D. Delehaunty ; Tracie L. Miner ; Andrew Delehaunty ; Jason B. Kramer ; Lisa L. Cook ; Robert S. Fulton ; Douglas L. Johnson ; Patrick J. Minx ; Sandra W. CliftonforWashington University Genome Sequencing Center ; Trevor Hawkins ; Elbert Branscomb ; Paul Predki ; Paul Richardson ; Sarah Wenning ; Tom Slezak ; Norman Doggett ; Jan-Fang Cheng ; Anne Olsen ; Susan Lucas ; Christopher Elkin ; Edward Uberbacher ; Marvin FrazierforUS DOE Joint Genome Institute ; Richard A. Gibbs ; Donna M. Muzny ; Steven E. Scherer ; John B. Bouck ; Erica J. Sodergren ; Kim C. Worley ; Catherine M. Rives ; James H. Gorrell ; Michael L. Metzker ; Susan L. Naylor ; Raju S. Kucherlapati ; David L. Nelson ; George M. WeinstockforBaylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center ; Yoshiyuki Sakaki ; Asao Fujiyama ; Masahira Hattori ; Tetsushi Yada ; Atsushi Toyoda ; Takehiko Itoh ; Chiharu Kawagoe ; Hidemi Watanabe ; Yasushi Totoki ; Todd TaylorforRIKEN Genomic Sciences Center ; Jean Weissenbach ; Roland Heilig ; William Saurin ; Francois Artiguenave ; Philippe Brottier ; Thomas Bruls ; Eric Pelletier ; Catherine Robert ; Patrick WinckerforGenoscope and CNRS UMR-8030 ; André ; Rosenthal ; Matthias Platzer ; Gerald Nyakatura ; Stefan Taudien ; Andreas RumpforDepartment of Genome Analysis ; Institute of Molecular Biotechnology ; Douglas R. Smith ; Lynn Doucette-Stamm ; Marc Rubenfield ; Keith Weinstock ; Hong Mei Lee ; JoAnn DuboisforGTC Sequencing Center ; Huanming Yang ; Jun Yu ; Jian Wang ; Guyang Huang ; Jun GuforBeijing Genomics Institute/Human Genome Center ; Leroy Hood ; Lee Rowen ; Anup Madan ; Shizen QinforMultimegabase Sequencing Center ; The Institute for Systems Biology ; Ronald W. Davis ; Nancy A. Federspiel ; A. Pia Abola ; Michael J. ProctorforStanford Genome Technology Center ; Bruce A. Roe ; Feng Chen ; Huaqin PanforUniversity of Oklahoma' ; s Advanced Center for Genome Technology ; Juliane Ramser ; Hans Lehrach ; Richard ReinhardtforMax Planck Institute for Molecular Genetics ; W. Richard McCombie ; Melissa de la Bastide ; Neilay DedhiaforCold Spring Harbor Laboratory ; Lita Annenberg Hazen Genome Center ; Helmut Blö ; cker ; Klaus Hornischer ; Gabriele NordsiekforGBF—German Research Centre for Biotechnology ; Richa Agarwala ; L. Aravind ; Jeffrey A. Bailey ; Alex Bateman ; Serafim Batzoglou ; Ewan Birney ; Peer Bork ; Daniel G. Brown ; Christopher B. Burge ; Lorenzo Cerutti ; Hsiu-Chuan Chen ; Deanna Church ; Michele Clamp ; Richard R. Copley ; Tobias Doerks ; Sean R. Eddy ; Evan E. Eichler ; Terrence S. Furey ; James Galagan ; James G. R. Gilbert ; Cyrus Harmon ; Yoshihide Hayashizaki ; David Haussler ; Henning Hermjakob ; Karsten Hokamp ; Wonhee Jang ; L. Steven Johnson ; Thomas A. Jones ; Simon Kasif ; Arek Kaspryzk ; Scot Kennedy ; W. James Kent ; Paul Kitts ; Eugene V. Koonin ; Ian Korf ; David Kulp ; Doron Lancet ; Todd M. Lowe ; Aoife McLysaght ; Tarjei Mikkelsen ; John V. Moran ; Nicola Mulder ; Victor J. Pollara ; Chris P. Ponting ; Greg Schuler ; Jö ; rg Schultz ; Guy Slater ; Arian F. A. Smit ; Elia Stupka ; Joseph Szustakowki ; Danielle Thierry-Mieg ; Jean Thierry-Mieg ; Lukas Wagner ; John Wallis ; Raymond Wheeler ; Alan Williams ; Yuri I. Wolf ; Kenneth H. Wolfe ; Shiaw-Pyng Yang ; Ru-Fang Yehfor*Genome Analysis Group (listed in alphabetical order ; also includes individuals listed under other headings) ; Francis Collins ; Mark S. Guyer ; Jane Peterson ; Adam Felsenfeld ; Kris A. WetterstrandforScientific management ; National Human Genome Research Institute ; US National Institutes of Health ; Richard M. Myers ; Jeremy Schmutz ; Mark Dickson ; Jane Grimwood ; David R. CoxforStanford Human Genome Center ; Maynard V. Olson ; Rajinder Kaul ; Christopher RaymondforUniversity of Washington Genome Center ; Nobuyoshi Shimizu ; Kazuhiko Kawasaki ; Shinsei MinoshimaforDepartment of Molecular Biology ; Keio University School of Medicine ; Glen A. Evans ; Maria Athanasiou ; Roger SchultzforUniversity of Texas Southwestern Medical Center at Dallas ; Aristides PatrinosforOffice of Science ; US Department of Energy ; Michael J. MorganforThe Wellcome Trust

刊名：Nature

出版年：2001