作者：Xander Nuttle ; Giuliana Giannuzzi ; Michael H. Duyzend ; Joshua G. Schraiber ; Iñ ; igo Narvaiza ; Peter H. Sudmant ; Osnat Penn ; Giorgia Chiatante ; Maika Malig ; John Huddleston ; Chris Benner ; Francesca Camponeschi ; Simone Ciofi-Baffoni ; Holly A. F. Stessman ; Maria C. N. Marchetto ; Laura Denman ; Lana Harshman ; Carl Baker ; Archana Raja ; Kelsi Penewit ; Nicolette Janke ; W. Joyce Tang ; Mario Ventura ; Lucia Banci ; Francesca Antonacci ; Joshua M. Akey ; Chris T. Amemiya ; Fred H. Gage ; Alexandre Reymond ; Evan E. Eichler

关键词：Genome evolution ; Evolutionary genetics

刊名：Nature

出版年：2016

作者：Mark J. P. Chaisson ; John Huddleston ; Megan Y. Dennis ; Peter H. Sudmant ; Maika Malig ; Fereydoun Hormozdiari ; Francesca Antonacci ; Urvashi Surti ; Richard Sandstrom ; Matthew Boitano ; Jane M. Landolin ; John A. Stamatoyannopoulos ; Michael W. Hunkapiller ; Jonas Korlach ; Evan E. Eichler

关键词：Comparative genomics ; Structural variation

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Peter H. Sudmant ; Tobias Rausch ; Eugene J. Gardner ; Robert E. Handsaker ; Alexej Abyzov ; John Huddleston ; Yan Zhang ; Kai Ye ; Goo Jun ; Markus Hsi-Yang Fritz ; Miriam K. Konkel ; Ankit Malhotra ; Adrian M. Stü ; tz ; Xinghua Shi ; Francesco Paolo Casale ; Jieming Chen ; Fereydoun Hormozdiari ; Gargi Dayama ; Ken Chen ; Maika Malig ; Mark J. P. Chaisson ; Klaudia Walter ; Sascha Meiers ; Seva Kashin ; Erik Garrison ; Adam Auton ; Hugo Y. K. Lam ; Xinmeng Jasmine Mu ; Can Alkan ; Danny Antaki ; Taejeong Bae ; Eliza Cerveira ; Peter Chines ; Zechen Chong ; Laura Clarke ; Elif Dal ; Li Ding ; Sarah Emery ; Xian Fan ; Madhusudan Gujral ; Fatma Kahveci ; Jeffrey M. Kidd ; Yu Kong ; Eric-Wubbo Lameijer ; Shane McCarthy ; Paul Flicek ; Richard A. Gibbs ; Gabor Marth ; Christopher E. Mason ; Androniki Menelaou ; Donna M. Muzny ; Bradley J. Nelson ; Amina Noor ; Nicholas F. Parrish ; Matthew Pendleton ; Andrew Quitadamo ; Benjamin Raeder ; Eric E. Schadt ; Mallory Romanovitch ; Andreas Schlattl ; Robert Sebra ; Andrey A. Shabalin ; Andreas Untergasser ; Jerilyn A. Walker ; Min Wang ; Fuli Yu ; Chengsheng Zhang ; Jing Zhang ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Wanding Zhou ; Thomas Zichner ; Jonathan Sebat ; Mark A. Batzer ; Steven A. McCarroll ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Ryan E. Mills ; Mark B. Gerstein ; Ali Bashir ; Oliver Stegle ; Scott E. Devine ; Charles Lee ; Evan E. Eichler ; Jan O. Korbel

关键词：Genomics ; Structural variation

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Lingling Shi ; Yunfei Guo ; Chengliang Dong ; John Huddleston ; Hui Yang ; Xiaolu Han ; Aisi Fu ; Quan Li ; Na Li ; Siyi Gong ; Katherine E. Lintner ; Qiong Ding ; Zou Wang ; Jiang Hu ; Depeng Wang ; Feng Wang ; Lin Wang ; Gholson J. Lyon ; Yongtao Guan ; Yufeng Shen ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Oleg V. Evgrafov ; James A. Knowles ; Francoise Thibaud-Nissen ; Valerie Schneider ; Chack-Yung Yu ; Libing Zhou ; Evan E. Eichler ; Kwok-Fai So ; Kai Wang

刊名：Nature Communications

出版年：2016

作者：Kay Prü ; fer ; Fernando Racimo ; Nick Patterson ; Flora Jay ; Sriram Sankararaman ; Susanna Sawyer ; Anja Heinze ; Gabriel Renaud ; Peter H. Sudmant ; Cesare de Filippo ; Heng Li ; Swapan Mallick ; Michael Dannemann ; Qiaomei Fu ; Martin Kircher ; Martin Kuhlwilm ; Michael Lachmann ; Matthias Meyer ; Matthias Ongyerth ; Michael Siebauer ; Christoph Theunert ; Arti Tandon ; Priya Moorjani ; Joseph Pickrell ; James C. Mullikin ; Samuel H. Vohr ; Richard E. Green ; Ines Hellmann ; Philip L. F. Johnson ; Hé ; lè ; ne Blanche ; Howard Cann ; Jacob O. Kitzman ; Jay Shendure ; Evan E. Eichler ; Ed S. Lein ; Trygve E. Bakken ; Liubov V. Golovanova ; Vladimir B. Doronichev ; Michael V. Shunkov ; Anatoli P. Derevianko ; Bence Viola ; Montgomery Slatkin ; David Reich ; Janet Kelso ; Svante Pä ; ä ; bo

关键词：Evolutionary genetics

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Lucia Carbone ; R. Alan Harris ; Sante Gnerre ; Krishna R. Veeramah ; Belen Lorente-Galdos ; John Huddleston ; Thomas J. Meyer ; Javier Herrero ; Christian Roos ; Bronwen Aken ; Fabio Anaclerio ; Nicoletta Archidiacono ; Carl Baker ; Daniel Barrell ; Mark A. Batzer ; Kathryn Beal ; Antoine Blancher ; Craig L. Bohrson ; Markus Brameier ; Michael S. Campbell ; Oronzo Capozzi ; Claudio Casola ; Giorgia Chiatante ; Andrew Cree ; Annette Damert ; Pieter J. de Jong ; Laura Dumas ; Marcos Fernandez-Callejo ; Paul Flicek ; Nina V. Fuchs ; Ivo Gut ; Marta Gut ; Matthew W. Hahn ; Jessica Hernandez-Rodriguez ; LaDeana W. Hillier ; Robert Hubley ; Bianca Ianc ; Zsuzsanna Izsvák ; Nina G. Jablonski ; Laurel M. Johnstone ; Anis Karimpour-Fard ; Miriam K. Konkel ; Dennis Kostka ; Nathan H. Lazar ; Sandra L. Lee ; Lora R. Lewis ; Yue Liu ; Devin P. Locke ; Swapan Mallick ; Fernando L. Mendez ; Matthieu Muffato ; Lynne V. Nazareth ; Kimberly A. Nevonen ; Majesta O’Bleness ; Cornelia Ochis ; Duncan T. Odom ; Katherine S. Pollard ; Javier Quilez ; David Reich ; Mariano Rocchi ; Gerald G. Schumann ; Stephen Searle ; James M. Sikela ; Gabriella Skollar ; Arian Smit ; Kemal Sonmez ; Boudewijn ten Hallers ; Elizabeth Terhune ; Gregg W. C. Thomas ; Brygg Ullmer ; Mario Ventura ; Jerilyn A. Walker ; Jeffrey D. Wall ; Lutz Walter ; Michelle C. Ward ; Sarah J. Wheelan ; Christopher W. Whelan ; Simon White ; Larry J. Wilhelm ; August E. Woerner ; Mark Yandell ; Baoli Zhu ; Michael F. Hammer ; Tomas Marques-Bonet ; Evan E. Eichler ; Lucinda Fulton ; Catrina Fronick ; Donna M. Muzny ; Wesley C. Warren ; Kim C. Worley ; Jeffrey Rogers ; Richard K. Wilson ; Richard A. Gibbs

关键词：Genome ; Structural variation ; Evolutionary genetics ; Next-generation sequencing

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Ivan Iossifov ; Brian J. O’Roak ; Stephan J. Sanders ; Michael Ronemus ; Niklas Krumm ; Dan Levy ; Holly A. Stessman ; Kali T. Witherspoon ; Laura Vives ; Karynne E. Patterson ; Joshua D. Smith ; Bryan Paeper ; Deborah A. Nickerson ; Jeanselle Dea ; Shan Dong ; Luis E. Gonzalez ; Jeffrey D. Mandell ; Shrikant M. Mane ; Michael T. Murtha ; Catherine A. Sullivan ; Michael F. Walker ; Zainulabedin Waqar ; Liping Wei ; A. Jeremy Willsey ; Boris Yamrom ; Yoon-ha Lee ; Ewa Grabowska ; Ertugrul Dalkic ; Zihua Wang ; Steven Marks ; Peter Andrews ; Anthony Leotta ; Jude Kendall ; Inessa Hakker ; Julie Rosenbaum ; Beicong Ma ; Linda Rodgers ; Jennifer Troge ; Giuseppe Narzisi ; Seungtai Yoon ; Michael C. Schatz ; Kenny Ye ; W. Richard McCombie ; Jay Shendure ; Evan E. Eichler ; Matthew W. State ; Michael Wigler

关键词：Medical genomics ; Neurodevelopmental disorders ; Genome informatics ; Autism spectrum disorders

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Feng Yue ; Yong Cheng ; Alessandra Breschi ; Jeff Vierstra ; Weisheng Wu ; Tyrone Ryba ; Richard Sandstrom ; Zhihai Ma ; Carrie Davis ; Benjamin D. Pope ; Yin Shen ; Dmitri D. Pervouchine ; Sarah Djebali ; Robert E. Thurman ; Rajinder Kaul ; Eric Rynes ; Anthony Kirilusha ; Georgi K. Marinov ; Brian A. Williams ; Diane Trout ; Henry Amrhein ; Katherine Fisher-Aylor ; Igor Antoshechkin ; Gilberto DeSalvo ; Lei-Hoon See ; Meagan Fastuca ; Jorg Drenkow ; Chris Zaleski ; Alex Dobin ; Pablo Prieto ; Julien Lagarde ; Giovanni Bussotti ; Andrea Tanzer ; Olgert Denas ; Kanwei Li ; M. A. Bender ; Miaohua Zhang ; Rachel Byron ; Mark T. Groudine ; David McCleary ; Long Pham ; Zhen Ye ; Samantha Kuan ; Lee Edsall ; Yi-Chieh Wu ; Matthew D. Rasmussen ; Mukul S. Bansal ; Manolis Kellis ; Cheryl A. Keller ; Christapher S. Morrissey ; Tejaswini Mishra ; Deepti Jain ; Nergiz Dogan ; Robert S. Harris ; Philip Cayting ; Trupti Kawli ; Alan P. Boyle ; Ghia Euskirchen ; Anshul Kundaje ; Shin Lin ; Yiing Lin ; Camden Jansen ; Venkat S. Malladi ; Melissa S. Cline ; Drew T. Erickson ; Vanessa M. Kirkup ; Katrina Learned ; Cricket A. Sloan ; Kate R. Rosenbloom ; Beatriz Lacerda de Sousa ; Kathryn Beal ; Miguel Pignatelli ; Paul Flicek ; Jin Lian ; Tamer Kahveci ; Dongwon Lee ; W. James Kent ; Miguel Ramalho Santos ; Javier Herrero ; Cedric Notredame ; Audra Johnson ; Shinny Vong ; Kristen Lee ; Daniel Bates ; Fidencio Neri ; Morgan Diegel ; Theresa Canfield ; Peter J. Sabo ; Matthew S. Wilken ; Thomas A. Reh ; Erika Giste ; Anthony Shafer ; Tanya Kutyavin ; Eric Haugen ; Douglas Dunn ; Alex P. Reynolds ; Shane Neph ; Richard Humbert ; R. Scott Hansen ; Marella De Bruijn ; Licia Selleri ; Alexander Rudensky ; Steven Josefowicz ; Robert Samstein ; Evan E. Eichler ; Stuart H. Orkin ; Dana Levasseur ; Thalia Papayannopoulou ; Kai-Hsin Chang ; Arthur Skoultchi ; Srikanta Gosh ; Christine Disteche ; Piper Treuting ; Yanli Wang ; Mitchell J. Weiss ; Gerd A. Blobel ; Xiaoyi Cao ; Sheng Zhong ; Ting Wang ; Peter J. Good ; Rebecca F. Lowdon ; Leslie B. Adams ; Xiao-Qiao Zhou ; Michael J. Pazin ; Elise A. Feingold ; Barbara Wold ; James Taylor ; Ali Mortazavi ; Sherman M. Weissman ; John A. Stamatoyannopoulos ; Michael P. Snyder ; Roderic Guigo ; Thomas R. Gingeras ; David M. Gilbert ; Ross C. Hardison ; Michael A. Beer ; Bing Ren ; The Mouse ENCODE Consortium

关键词：Epigenomics

刊名：Nature

出版年：2014

作者：Xander Nuttle ; Andy Itsara ; Jay Shendure ; Evan E Eichler

刊名：Nature Protocols

出版年：2014

作者：Olivier Delaneau ; Jonathan Marchini ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Gil A. McVean ; Peter Donnelly ; Gerton Lunter ; Jonathan L. Marchini ; Simon Myers ; Anjali Gupta-Hinch ; Zamin Iqbal ; Iain Mathieson ; Andy Rimmer ; Dionysia K. Xifara ; Angeliki Kerasidou ; Claire Churchhouse ; Olivier Delaneau ; David M. Altshuler ; Stacey B. Gabriel ; Eric S. Lander ; Namrata Gupta ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Mark J. Daly ; Mark A. DePristo ; Eric Banks ; Gaurav Bhatia ; Mauricio O. Carneiro ; Guillermo del Angel ; Giulio Genovese ; Robert E. Handsaker ; Chris Hart ; Steven A. McCarroll ; James C. Nemesh ; Ryan E. Poplin ; Stephen F. Schaffner ; Khalid Shakir ; Pardis C. Sabeti ; Sharon R. Grossman ; Shervin Tabrizi ; Ridhi Tariya ; Heng Li ; David Reich ; Richard M. Durbin ; Matthew E. Hurles ; Senduran Balasubramaniam ; John Burton ; Petr Danecek ; Thomas M. Keane ; Anja Kolb-Kokocinski ; Shane McCarthy ; James Stalker ; Michael Quail ; Qasim Ayub ; Yuan Chen ; Alison J. Coffey ; Vincenza Colonna ; Ni Huang ; Luke Jostins ; Aylwyn Scally ; Klaudia Walter ; Yali Xue ; Yujun Zhang ; Ben Blackburne ; Sarah J. Lindsay ; Zemin Ning ; Adam Frankish ; Jennifer Harrow ; Chris Tyler-Smith ; Gonalo R. Abecasis ; Hyun Min Kang ; Paul Anderson ; Tom Blackwell ; Fabio Busonero ; Christian Fuchsberger ; Goo Jun ; Andrea Maschio ; Eleonora Porcu ; Carlo Sidore ; Adrian Tan ; Mary Kate Trost ; David R. Bentley ; Russell Grocock ; Sean Humphray ; Terena James ; Zoya Kingsbury ; Markus Bauer ; R. Keira Cheetham ; Tony Cox ; Michael Eberle ; Lisa Murray ; Richard Shaw ; Aravinda Chakravarti ; Andrew G. Clark ; Alon Keinan ; Juan L. Rodriguez-Flores ; Francisco M. De La Vega ; Jeremiah Degenhardt ; Evan E. Eichler ; Paul Flicek ; Laura Clarke ; Rasko Leinonen ; Richard E. Smith ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Kathryn Beal ; Fiona Cunningham ; Javier Herrero ; William M. McLaren ; Graham R. S. Ritchie ; Jonathan Barker ; Gavin Kelman ; Eugene Kulesha ; Rajesh Radhakrishnan ; Asier Roa ; Dmitriy Smirnov ; Ian Streeter ; Iliana Toneva ; Richard A. Gibbs ; Huyen Dinh ; Christie Kovar ; Sandra Lee ; Lora Lewis ; Donna Muzny ; Jeff Reid ; Min Wang ; Fuli Yu ; Matthew Bainbridge ; Danny Challis ; Uday S. Evani ; James Lu ; Uma Nagaswamy ; Aniko Sabo ; Yi Wang ; Jin Yu ; Gerald Fowler ; Walker Hale ; Divya Kalra ; Eric D. Green ; Bartha M. Knoppers ; Jan O. Korbel ; Tobias Rausch ; Adrian M. Sttz ; Charles Lee ; Lauren Griffin ; Chih-Heng Hsieh ; Ryan E. Mills ; Marcin von Grotthuss ; Chengsheng Zhang ; Xinghua Shi ; Hans Lehrach ; Ralf Sudbrak ; Vyacheslav S. Amstislavskiy ; Matthias Lienhard ; Florian Mertes ; Marc Sultan ; Bernd Timmermann ; Marie-Laure Yaspo ; Sudbrak ; Ralf Herwig ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson ; Lucinda Fulton ; Robert Fulton ; George M. Weinstock ; Asif Chinwalla ; Li Ding ; David Dooling ; Daniel C. Koboldt ; Michael D. McLellan ; John W. Wallis ; Michael C. Wendl ; Qunyuan Zhang ; Gabor T. Marth ; Erik P. Garrison ; Deniz Kural ; Wan-Ping Lee ; Wen Fung Leong ; Alistair N. Ward ; Jiantao Wu ; Mengyao Zhang ; Deborah A. Nickerson ; Can Alkan ; Fereydoun Hormozdiari ; Arthur Ko ; Peter H. Sudmant ; Jeanette P. Schmidt ; Christopher J. Davies ; Jeremy Gollub ; Teresa Webster ; Brant Wong ; Yiping Zhan ; Stephen T. Sherry ; Chunlin Xiao ; Deanna Church ; Victor Ananiev ; Zinaida Belaia ; Dimitriy Beloslyudtsev ; Nathan Bouk ; Chao Chen ; Robert Cohen ; Charles Cook ; John Garner ; Timothy Hefferon ; Mikhail Kimelman ; Chunlei Liu ; John Lopez ; Peter Meric ; Yuri Ostapchuk ; Lon Phan ; Sergiy Ponomarov ; Valerie Schneider ; Eugene Shekhtman ; Karl Sirotkin ; Douglas Slotta ; Hua Zhang ; Jun Wang ; Xiaodong Fang ; Xiaosen Guo ; Min Jian ; Hui Jiang ; Xin Jin ; Guoqing Li ; Jingxiang Li ; Yingrui Li ; Xiao Liu ; Yao Lu ; Xuedi Ma ; Shuaishuai Tai ; Meifang Tang ; Bo Wang ; Guangbiao Wang ; Honglong Wu ; Renhua Wu ; Ye Yin ; Wenwei Zhang ; Jiao Zhao ; Meiru Zhao ; Xiaole Zheng ; Lachlan J.M. Coin ; Lin Fang ; Qibin Li ; Zhenyu Li ; Haoxiang Lin ; Binghang Liu ; Ruibang Luo ; Haojing Shao ; Bingqiang Wang ; Yinlong Xie ; Chen Ye ; Chang Yu ; Hancheng Zheng ; Hongmei Zhu ; Hongyu Cai ; Hongzhi Cao ; Yeyang Su ; Zhongming Tian ; Huanming Yang ; Ling Yang ; Jiayong Zhu ; Zhiming Cai ; Jian Wang ; Marcus W. Albrecht ; Tatiana A. Borodina ; Adam Auton ; Seungtai C. Yoon ; Jayon Lihm ; Vladimir Makarov ; Hanjun Jin ; Wook Kim ; Ki Cheol Kim ; Srikanth Gottipati ; Danielle Jones ; David N. Cooper ; Edward V. Ball ; Peter D. Stenson ; Bret Barnes ; Scott Kahn ; Kai Ye ; Mark A. Batzer ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Daniel G. MacArthur ; Monkol Lek ; Mark D. Shriver ; Carlos D. Bustamante ; Simon Gravel ; Eimear E. Kenny ; Jeffrey M. Kidd ; Phil Lacroute ; Brian K. Maples ; Andres Moreno-Estrada ; Fouad Zakharia ; Brenna Henn ; Karla Sandoval ; Jake K. Byrnes ; Eran Halperin ; Yael Baran ; David W. Craig ; Alexis Christoforides ; Tyler Izatt ; Ahmet A. Kurdoglu ; Shripad A. Sinari ; Nils Homer ; Kevin Squire ; Jonathan Sebat ; Vineet Bafna ; Kenny Ye ; Esteban G. Burchard ; Ryan D. Hernandez ; Christopher R. Gignoux ; David Haussler ; Sol J. Katzman ; W. James Kent ; Bryan Howie ; Andres Ruiz-Linares ; Emmanouil T. Dermitzakis ; Tuuli Lappalainen ; Scott E. Devine ; Xinyue Liu ; Ankit Maroo ; Luke J. Tallon ; Jeffrey A. Rosenfeld ; Leslie P. Michelson ; Andrea Angius ; Francesco Cucca ; Serena Sanna ; Abigail Bigham ; Chris Jones ; Fred Reinier ; Yun Li ; Robert Lyons ; David Schlessinger ; Philip Awadalla ; Alan Hodgkinson ; Taras K. Oleksyk ; Juan C. Martinez-Cruzado ; Yunxin Fu ; Xiaoming Liu ; Momiao Xiong ; Lynn Jorde ; David Witherspoon ; Jinchuan Xing ; Brian L. Browning ; Iman Hajirasouliha ; Ken Chen ; Cornelis A. Albers ; Mark B. Gerstein ; Alexej Abyzov ; Jieming Chen ; Yao Fu ; Lukas Habegger ; Arif O. Harmanci ; Xinmeng Jasmine Mu ; Cristina Sisu ; Suganthi Balasubramanian ; Mike Jin ; Ekta Khurana ; Declan Clarke ; Jacob J. Michaelson ; Chris OSullivan ; Kathleen C. Barnes ; Neda Gharani ; Lorraine H. Toji ; Norman Gerry ; Jane S. Kaye ; Alastair Kent ; Rasika Mathias ; Pilar N. Ossorio ; Michael Parker ; Charles N. Rotimi ; Charmaine D. Royal ; Sarah Tishkoff ; Marc Via ; Walter Bodmer ; Gabriel Bedoya ; Gao Yang ; Chu Jia You ; Andres Garcia-Montero ; Alberto Orfao ; Julie Dutil ; Lisa D. Brooks ; Adam L. Felsenfeld ; Jean E. McEwen ; Nicholas C. Clemm ; Mark S. Guyer ; Jane L. Peterson ; Audrey Duncanson ; Michael Dunn ; Leena Peltonenz

刊名：Nature Communications

出版年：2014