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1. High throughput 16SrRNA gene sequencing reveals the correlation between Propionibacterium acnes and sarcoidosis

作者： Meng-Meng Zhao ; Shan-Shan Du ; Qiu-Hong Li ; Tao Chen ; Hui Qiu…

关键词：High throughput gene sequencing ; Propionibacteria ; Sarcoidosis ; 16SrRNA

刊名：Respiratory Research

出版年：2017

2. Considerations and complications of mapping small RNA high-throughput data to transposable elements

作者： Alexandros Bousios ; Brandon S. Gaut ; Nikos Darzentas

关键词：Transposable elements ; Small RNAs ; High ; throughput sequencing ; siRNAs ; Genome mapping ; Annotation ; Bioinformatics ; RNA ; seq

刊名：Mobile DNA

出版年：2017

3. Identification and characterization of long non-coding RNAs in response to early infection by Melampsora larici-populina using genome-wide high-throughput RNA sequencing

作者： Nian Wang ; Pei Cao ; Wenxiu Xia ; Linchuan Fang ; Hongyan Yu

关键词：LncRNAs ; Poplar ; Melampsora larici ; populina ; RNA ; Seq ; Plant ; pathogen interactions

刊名：Tree Genetics & Genomes

出版年：2017

4. Variant discovery in the sheep milk transcriptome using RNA sequencing

作者： Aroa Suárez-Vega ; Beatriz Gutiérrez-Gil ; Christophe Klopp…

关键词：Dairy Sheep ; Milk Somatic Cells ; RNA ; Seq ; Transcriptome Variants

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

5. Gene set analysis controlling for length bias in RNA-seq experiments

作者： Xing Ren ; Qiang Hu ; Song Liu ; Jianmin Wang ; Jeffrey C. Miecznikowski

关键词：RNA ; seq ; Gene set analysis ; Gene length bias ; Maxmean statistic ; Restandardization

刊名：BioData Mining

出版年：2017

6. Random X-chromosome inactivation dynamics in vivo by single-cell RNA sequencing

作者： Menghan Wang ; Fangqin Lin ; Ke Xing ; Li Liu

关键词：KeywordX ; chromosome inactivation ; Single ; cell analysis ; High ; throughput nucleotide sequencing

刊名：BMC Genomics

出版年：2017

7. Identification of anthocyanin biosynthesis related microRNAs in a distinctive Chinese radish (Raphanus sativus L.) by high-throughput sequencing

作者： Yuyan Sun ; Yang Qiu ; Mengmeng Duan ; Jinglei Wang…

关键词：Raphanus sativus L. ; Xinlimei ; MicroRNA ; Anthocyanin biosynthesis ; Solexa sequencing technology

刊名：Molecular Genetics and Genomics

出版年：2017

8. RNA virus receptor Rig-I monitors gut microbiota and inhibits colitis-associated colorectal cancer

作者： Houbao Zhu ; Wang-Yang Xu ; Zhiqiang Hu…

关键词：RigI ; Gut microbiota ; Colorectal cancer ; Mouse model ; High ; throughput sequencing

刊名：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research

出版年：2017

9. Development of a genetically programed vanillin-sensing bacterium for high-throughput screening of lignin-degrading enzyme libraries

作者： Barindra Sana ; Kuan Hui Burton Chia ; Sarada S. Raghavan…

关键词：Directed evolution ; Fluorescence ; activated cell sorting ; RNA sequencing ; Lignin ; Vanillin ; Enzyme engineering ; Biorefinery ; Vanillin ; inducible promoter ; Microbial biosensor ; High ; throughput screening

刊名：Biotechnology for Biofuels

出版年：2017

10. A fast and robust protocol for metataxonomic analysis using RNAseq data

作者： Jeremy W. Cox ; Richard A. Ballweg ; Diana H. Taft ; Prakash Velayutham…

关键词：Microbiome ; Metagenome ; Metatranscriptome ; Metataxonomics ; RNAseq ; Assembly of shotgun reads ; Altered Schaedler flora

刊名：Microbiome

出版年：2017

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