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3.Integrating sequence and array data to create an improved 1000 Genomes Project haplotype reference panel
作者：Olivier Delaneau ; Jonathan Marchini ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Gil A. McVean ; Peter Donnelly ; Gerton Lunter ; Jonathan L. Marchini ; Simon Myers ; Anjali Gupta-Hinch ; Zamin Iqbal ; Iain Mathieson ; Andy Rimmer ; Dionysia K. Xifara ; Angeliki Kerasidou ; Claire Churchhouse ; Olivier Delaneau ; David M. Altshuler ; Stacey B. Gabriel ; Eric S. Lander ; Namrata Gupta ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Mark J. Daly ; Mark A. DePristo ; Eric Banks ; Gaurav Bhatia ; Mauricio O. Carneiro ; Guillermo del Angel ; Giulio Genovese ; Robert E. Handsaker ; Chris Hart ; Steven A. McCarroll ; James C. Nemesh ; Ryan E. Poplin ; Stephen F. Schaffner ; Khalid Shakir ; Pardis C. Sabeti ; Sharon R. Grossman ; Shervin Tabrizi ; Ridhi Tariya ; Heng Li ; David Reich ; Richard M. Durbin ; Matthew E. Hurles ; Senduran Balasubramaniam ; John Burton ; Petr Danecek ; Thomas M. Keane ; Anja Kolb-Kokocinski ; Shane McCarthy ; James Stalker ; Michael Quail ; Qasim Ayub ; Yuan Chen ; Alison J. Coffey ; Vincenza Colonna ; Ni Huang ; Luke Jostins ; Aylwyn Scally ; Klaudia Walter ; Yali Xue ; Yujun Zhang ; Ben Blackburne ; Sarah J. Lindsay ; Zemin Ning ; Adam Frankish ; Jennifer Harrow ; Chris Tyler-Smith ; Gonalo R. Abecasis ; Hyun Min Kang ; Paul Anderson ; Tom Blackwell ; Fabio Busonero ; Christian Fuchsberger ; Goo Jun ; Andrea Maschio ; Eleonora Porcu ; Carlo Sidore ; Adrian Tan ; Mary Kate Trost ; David R. Bentley ; Russell Grocock ; Sean Humphray ; Terena James ; Zoya Kingsbury ; Markus Bauer ; R. Keira Cheetham ; Tony Cox ; Michael Eberle ; Lisa Murray ; Richard Shaw ; Aravinda Chakravarti ; Andrew G. Clark ; Alon Keinan ; Juan L. Rodriguez-Flores ; Francisco M. De La Vega ; Jeremiah Degenhardt ; Evan E. Eichler ; Paul Flicek ; Laura Clarke ; Rasko Leinonen ; Richard E. Smith ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Kathryn Beal ; Fiona Cunningham ; Javier Herrero ; William M. McLaren ; Graham R. S. Ritchie ; Jonathan Barker ; Gavin Kelman ; Eugene Kulesha ; Rajesh Radhakrishnan ; Asier Roa ; Dmitriy Smirnov ; Ian Streeter ; Iliana Toneva ; Richard A. Gibbs ; Huyen Dinh ; Christie Kovar ; Sandra Lee ; Lora Lewis ; Donna Muzny ; Jeff Reid ; Min Wang ; Fuli Yu ; Matthew Bainbridge ; Danny Challis ; Uday S. Evani ; James Lu ; Uma Nagaswamy ; Aniko Sabo ; Yi Wang ; Jin Yu ; Gerald Fowler ; Walker Hale ; Divya Kalra ; Eric D. Green ; Bartha M. Knoppers ; Jan O. Korbel ; Tobias Rausch ; Adrian M. Sttz ; Charles Lee ; Lauren Griffin ; Chih-Heng Hsieh ; Ryan E. Mills ; Marcin von Grotthuss ; Chengsheng Zhang ; Xinghua Shi ; Hans Lehrach ; Ralf Sudbrak ; Vyacheslav S. Amstislavskiy ; Matthias Lienhard ; Florian Mertes ; Marc Sultan ; Bernd Timmermann ; Marie-Laure Yaspo ; Sudbrak ; Ralf Herwig ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson ; Lucinda Fulton ; Robert Fulton ; George M. Weinstock ; Asif Chinwalla ; Li Ding ; David Dooling ; Daniel C. Koboldt ; Michael D. McLellan ; John W. Wallis ; Michael C. Wendl ; Qunyuan Zhang ; Gabor T. Marth ; Erik P. Garrison ; Deniz Kural ; Wan-Ping Lee ; Wen Fung Leong ; Alistair N. Ward ; Jiantao Wu ; Mengyao Zhang ; Deborah A. Nickerson ; Can Alkan ; Fereydoun Hormozdiari ; Arthur Ko ; Peter H. Sudmant ; Jeanette P. Schmidt ; Christopher J. Davies ; Jeremy Gollub ; Teresa Webster ; Brant Wong ; Yiping Zhan ; Stephen T. Sherry ; Chunlin Xiao ; Deanna Church ; Victor Ananiev ; Zinaida Belaia ; Dimitriy Beloslyudtsev ; Nathan Bouk ; Chao Chen ; Robert Cohen ; Charles Cook ; John Garner ; Timothy Hefferon ; Mikhail Kimelman ; Chunlei Liu ; John Lopez ; Peter Meric ; Yuri Ostapchuk ; Lon Phan ; Sergiy Ponomarov ; Valerie Schneider ; Eugene Shekhtman ; Karl Sirotkin ; Douglas Slotta ; Hua Zhang ; Jun Wang ; Xiaodong Fang ; Xiaosen Guo ; Min Jian ; Hui Jiang ; Xin Jin ; Guoqing Li ; Jingxiang Li ; Yingrui Li ; Xiao Liu ; Yao Lu ; Xuedi Ma ; Shuaishuai Tai ; Meifang Tang ; Bo Wang ; Guangbiao Wang ; Honglong Wu ; Renhua Wu ; Ye Yin ; Wenwei Zhang ; Jiao Zhao ; Meiru Zhao ; Xiaole Zheng ; Lachlan J.M. Coin ; Lin Fang ; Qibin Li ; Zhenyu Li ; Haoxiang Lin ; Binghang Liu ; Ruibang Luo ; Haojing Shao ; Bingqiang Wang ; Yinlong Xie ; Chen Ye ; Chang Yu ; Hancheng Zheng ; Hongmei Zhu ; Hongyu Cai ; Hongzhi Cao ; Yeyang Su ; Zhongming Tian ; Huanming Yang ; Ling Yang ; Jiayong Zhu ; Zhiming Cai ; Jian Wang ; Marcus W. Albrecht ; Tatiana A. Borodina ; Adam Auton ; Seungtai C. Yoon ; Jayon Lihm ; Vladimir Makarov ; Hanjun Jin ; Wook Kim ; Ki Cheol Kim ; Srikanth Gottipati ; Danielle Jones ; David N. Cooper ; Edward V. Ball ; Peter D. Stenson ; Bret Barnes ; Scott Kahn ; Kai Ye ; Mark A. Batzer ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Daniel G. MacArthur ; Monkol Lek ; Mark D. Shriver ; Carlos D. Bustamante ; Simon Gravel ; Eimear E. Kenny ; Jeffrey M. Kidd ; Phil Lacroute ; Brian K. Maples ; Andres Moreno-Estrada ; Fouad Zakharia ; Brenna Henn ; Karla Sandoval ; Jake K. Byrnes ; Eran Halperin ; Yael Baran ; David W. Craig ; Alexis Christoforides ; Tyler Izatt ; Ahmet A. Kurdoglu ; Shripad A. Sinari ; Nils Homer ; Kevin Squire ; Jonathan Sebat ; Vineet Bafna ; Kenny Ye ; Esteban G. Burchard ; Ryan D. Hernandez ; Christopher R. Gignoux ; David Haussler ; Sol J. Katzman ; W. James Kent ; Bryan Howie ; Andres Ruiz-Linares ; Emmanouil T. Dermitzakis ; Tuuli Lappalainen ; Scott E. Devine ; Xinyue Liu ; Ankit Maroo ; Luke J. Tallon ; Jeffrey A. Rosenfeld ; Leslie P. Michelson ; Andrea Angius ; Francesco Cucca ; Serena Sanna ; Abigail Bigham ; Chris Jones ; Fred Reinier ; Yun Li ; Robert Lyons ; David Schlessinger ; Philip Awadalla ; Alan Hodgkinson ; Taras K. Oleksyk ; Juan C. Martinez-Cruzado ; Yunxin Fu ; Xiaoming Liu ; Momiao Xiong ; Lynn Jorde ; David Witherspoon ; Jinchuan Xing ; Brian L. Browning ; Iman Hajirasouliha ; Ken Chen ; Cornelis A. Albers ; Mark B. Gerstein ; Alexej Abyzov ; Jieming Chen ; Yao Fu ; Lukas Habegger ; Arif O. Harmanci ; Xinmeng Jasmine Mu ; Cristina Sisu ; Suganthi Balasubramanian ; Mike Jin ; Ekta Khurana ; Declan Clarke ; Jacob J. Michaelson ; Chris OSullivan ; Kathleen C. Barnes ; Neda Gharani ; Lorraine H. Toji ; Norman Gerry ; Jane S. Kaye ; Alastair Kent ; Rasika Mathias ; Pilar N. Ossorio ; Michael Parker ; Charles N. Rotimi ; Charmaine D. Royal ; Sarah Tishkoff ; Marc Via ; Walter Bodmer ; Gabriel Bedoya ; Gao Yang ; Chu Jia You ; Andres Garcia-Montero ; Alberto Orfao ; Julie Dutil ; Lisa D. Brooks ; Adam L. Felsenfeld ; Jean E. McEwen ; Nicholas C. Clemm ; Mark S. Guyer ; Jane L. Peterson ; Audrey Duncanson ; Michael Dunn ; Leena Peltonenz
刊名：Nature Communications
出版年：2014
5.Comparative and demographic analysis of orang-utan genomes
作者：Devin P. Locke ; LaDeana W. Hillier ; Wesley C. Warren ; Kim C. Worley ; Lynne V. Nazareth ; Donna M. Muzny ; Shiaw-Pyng Yang ; Zhengyuan Wang ; Asif T. Chinwalla ; Pat Minx ; Makedonka Mitreva ; Lisa Cook ; Kim D. Delehaunty ; Catrina Fronick ; Heather Schmidt ; Lucinda A. Fulton ; Robert S. Fulton ; Joanne O. Nelson ; Vincent Magrini ; Craig Pohl ; Tina A. Graves ; Chris Markovic ; Andy Cree ; Huyen H. Dinh ; Jennifer Hume ; Christie L. Kovar ; Gerald R. Fowler ; Gerton Lunter ; Stephen Meader ; Andreas Heger ; Chris P. Ponting ; Tomas Marques-Bonet ; Can Alkan ; Lin Chen ; Ze Cheng ; Jeffrey M. Kidd ; Evan E. Eichler ; Simon White ; Stephen Searle ; Albert J. Vilella ; Yuan Chen ; Paul Flicek ; Jian Ma ; Brian Raney ; Bernard Suh ; Richard Burhans ; Javier Herrero ; David Haussler ; Rui Faria ; Olga Fernando ; Fleur Darré ; Domè ; nec Farré ; Elodie Gazave ; Meritxell Oliva ; Arcadi Navarro ; Roberta Roberto ; Oronzo Capozzi ; Nicoletta Archidiacono ; Giuliano Della Valle ; Stefania Purgato ; Mariano Rocchi ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Brygg Ullmer ; Mark A. Batzer ; Arian F. A. Smit ; Robert Hubley ; Claudio Casola ; Daniel R. Schrider ; Matthew W. Hahn ; Victor Quesada ; Xose S. Puente ; Gonzalo R. Ordoñ ; ez ; Carlos Ló ; pez-Otín ; Tomas Vinar ; Brona Brejova ; Aakrosh Ratan ; Robert S. Harris ; Webb Miller ; Carolin Kosiol ; Heather A. Lawson ; Vikas Taliwal ; André ; L. Martins ; Adam Siepel ; Arindam RoyChoudhury ; Xin Ma ; Jeremiah Degenhardt ; Carlos D. Bustamante ; Ryan N. Gutenkunst ; Thomas Mailund ; Julien Y. Dutheil ; Asger Hobolth ; Mikkel H. Schierup ; Oliver A. Ryder ; Yuko Yoshinaga ; Pieter J. de Jong ; George M. Weinstock ; Jeffrey Rogers ; Elaine R. Mardis ; Richard A. Gibbs ; Richard K. Wilson
刊名：Nature
出版年：2011
6.Genome remodelling in a basal-like breast cancer metastasis and xenograft
作者：Li Ding ; Matthew J. Ellis ; Shunqiang Li ; David E. Larson ; Ken Chen ; John W. Wallis ; Christopher C. Harris ; Michael D. McLellan ; Robert S. Fulton ; Lucinda L. Fulton ; Rachel M. Abbott ; Jeremy Hoog ; David J. Dooling ; Daniel C. Koboldt ; Heather Schmidt ; Joelle Kalicki ; Qunyuan Zhang ; Lei Chen ; Ling Lin ; Michael C. Wendl ; Joshua F. McMichael ; Vincent J. Magrini ; Lisa Cook ; Sean D. McGrath ; Tammi L. Vickery ; Elizabeth Appelbaum ; Katherine DeSchryver ; Sherri Davies ; Therese Guintoli ; Li Lin ; Robert Crowder ; Yu Tao ; Jacqueline E. Snider ; Scott M. Smith ; Adam F. Dukes ; Gabriel E. Sanderson ; Craig S. Pohl ; Kim D. Delehaunty ; Catrina C. Fronick ; Kimberley A. Pape ; Jerry S. Reed ; Jody S. Robinson ; Jennifer S. Hodges ; William Schierding ; Nathan D. Dees ; Dong Shen ; Devin P. Locke ; Madeline E. Wiechert ; James M. Eldred ; Josh B. Peck ; Benjamin J. Oberkfell ; Justin T. Lolofie ; Feiyu Du ; Amy E. Hawkins ; Michelle D. O’Laughlin ; Kelly E. Bernard ; Mark Cunningham ; Glendoria Elliott ; Mark D. Mason ; Dominic M. Thompson Jr ; Jennifer L. Ivanovich ; Paul J. Goodfellow ; Charles M. Perou ; George M. Weinstock ; Rebecca Aft ; Mark Watson ; Timothy J. Ley ; Richard K. Wilson ; Elaine R. Mardis
刊名：Nature
出版年：2010
8.Genome analysis of the platypus reveals unique signatures of evolution
作者：Wesley C. Warren ; LaDeana W. Hillier ; Jennifer A. Marshall Graves ; Ewan Birney ; Chris P. Ponting ; Frank Grü ; tzner ; Katherine Belov ; Webb Miller ; Laura Clarke ; Asif T. Chinwalla ; Shiaw-Pyng Yang ; Andreas Heger ; Devin P. Locke ; Pat Miethke ; Paul D. Waters ; Fré ; dé ; ric Veyrunes ; Lucinda Fulton ; Bob Fulton ; Tina Graves ; John Wallis ; Xose S. Puente ; Carlos Ló ; pez-Otín ; Gonzalo R. Ordó ; ñ ; ez ; Evan E. Eichler ; Lin Chen ; Ze Cheng ; Janine E. Deakin ; Amber Alsop ; Katherine Thompson ; Patrick Kirby ; Anthony T. Papenfuss ; Matthew J. Wakefield ; Tsviya Olender ; Doron Lancet ; Gavin A. Huttley ; Arian F. A. Smit ; Andrew Pask ; Peter Temple-Smith ; Mark A. Batzer ; Jerilyn A. Walker ; Miriam K. Konkel ; Robert S. Harris ; Camilla M. Whittington ; Emily S. W. Wong ; Neil J. Gemmell ; Emmanuel Buschiazzo ; Iris M. Vargas Jentzsch ; Angelika Merkel ; Juergen Schmitz ; Anja Zemann ; Gennady Churakov ; Jan Ole Kriegs ; Juergen Brosius ; Elizabeth P. Murchison ; Ravi Sachidanandam ; Carly Smith ; Gregory J. Hannon ; Enkhjargal Tsend-Ayush ; Daniel McMillan ; Rosalind Attenborough ; Willem Rens ; Malcolm Ferguson-Smith ; Christophe M. Lefè ; vre ; Julie A. Sharp ; Kevin R. Nicholas ; David A. Ray ; Michael Kube ; Richard Reinhardt ; Thomas H. Pringle ; James Taylor ; Russell C. Jones ; Brett Nixon ; Jean-Louis Dacheux ; Hitoshi Niwa ; Yoko Sekita ; Xiaoqiu Huang ; Alexander Stark ; Pouya Kheradpour ; Manolis Kellis ; Paul Flicek ; Yuan Chen ; Caleb Webber ; Ross Hardison ; Joanne Nelson ; Kym Hallsworth-Pepin ; Kim Delehaunty ; Chris Markovic ; Pat Minx ; Yucheng Feng ; Colin Kremitzki ; Makedonka Mitreva ; Jarret Glasscock ; Todd Wylie ; Patricia Wohldmann ; Prathapan Thiru ; Michael N. Nhan ; Craig S. Pohl ; Scott M. Smith ; Shunfeng Hou ; Mikhail Nefedov ; Pieter J. de Jong ; Marilyn B. Renfree ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson
刊名：Nature
出版年：2008
9.DNA sequencing of a cytogenetically normal acute myeloid leukaemia genome
作者：Timothy J. Ley ; Elaine R. Mardis ; Li Ding ; Bob Fulton ; Michael D. McLellan ; Ken Chen ; David Dooling ; Brian H. Dunford-Shore ; Sean McGrath ; Matthew Hickenbotham ; Lisa Cook ; Rachel Abbott ; David E. Larson ; Dan C. Koboldt ; Craig Pohl ; Scott Smith ; Amy Hawkins ; Scott Abbott ; Devin Locke ; LaDeana W. Hillier ; Tracie Miner ; Lucinda Fulton ; Vincent Magrini ; Todd Wylie ; Jarret Glasscock ; Joshua Conyers ; Nathan Sander ; Xiaoqi Shi ; John R. Osborne ; Patrick Minx ; David Gordon ; Asif Chinwalla ; Yu Zhao ; Rhonda E. Ries ; Jacqueline E. Payton ; Peter Westervelt ; Michael H. Tomasson ; Mark Watson ; Jack Baty ; Jennifer Ivanovich ; Sharon Heath ; William D. Shannon ; Rakesh Nagarajan ; Matthew J. Walter ; Daniel C. Link ; Timothy A. Graubert ; John F. DiPersio ; Richard K. Wilson
刊名：Nature
出版年：2008
10.Somatic mutations affect key pathways in lung adenocarcinoma
作者：Li Ding ; Gad Getz ; David A. Wheeler ; Elaine R. Mardis ; Michael D. McLellan ; Kristian Cibulskis ; Carrie Sougnez ; Heidi Greulich ; Donna M. Muzny ; Margaret B. Morgan ; Lucinda Fulton ; Robert S. Fulton ; Qunyuan Zhang ; Michael C. Wendl ; Michael S. Lawrence ; David E. Larson ; Ken Chen ; David J. Dooling ; Aniko Sabo ; Alicia C. Hawes ; Hua Shen ; Shalini N. Jhangiani ; Lora R. Lewis ; Otis Hall ; Yiming Zhu ; Tittu Mathew ; Yanru Ren ; Jiqiang Yao ; Steven E. Scherer ; Kerstin Clerc ; Ginger A. Metcalf ; Brian Ng ; Aleksandar Milosavljevic ; Manuel L. Gonzalez-Garay ; John R. Osborne ; Rick Meyer ; Xiaoqi Shi ; Yuzhu Tang ; Daniel C. Koboldt ; Ling Lin ; Rachel Abbott ; Tracie L. Miner ; Craig Pohl ; Ginger Fewell ; Carrie Haipek ; Heather Schmidt ; Brian H. Dunford-Shore ; Aldi Kraja ; Seth D. Crosby ; Christopher S. Sawyer ; Tammi Vickery ; Sacha Sander ; Jody Robinson ; Wendy Winckler ; Jennifer Baldwin ; Lucian R. Chirieac ; Amit Dutt ; Tim Fennell ; Megan Hanna ; Bruce E. Johnson ; Robert C. Onofrio ; Roman K. Thomas ; Giovanni Tonon ; Barbara A. Weir ; Xiaojun Zhao ; Liuda Ziaugra ; Michael C. Zody ; Thomas Giordano ; Mark B. Orringer ; Jack A. Roth ; Margaret R. Spitz ; Ignacio I. Wistuba ; Bradley Ozenberger ; Peter J. Good ; Andrew C. Chang ; David G. Beer ; Mark A. Watson ; Marc Ladanyi ; Stephen Broderick ; Akihiko Yoshizawa ; William D. Travis ; William Pao ; Michael A. Province ; George M. Weinstock ; Harold E. Varmus ; Stacey B. Gabriel ; Eric S. Lander ; Richard A. Gibbs ; Matthew Meyerson ; Richard K. Wilson
刊名：Nature
出版年：2008
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