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1.The use of molecular dynamics simulations to evaluate the DNA sequence-selectivity of G-A cross-linking PBD-duocarmycin dimers

作者：Paul J.M. Jackson ; Khondaker M. Rahman ; David E. Thurston

关键词：DNA cross-linking ; Pyrrolobenzodiazepine ; Duocarmycin ; PBD&ndash ; CPI dimer ; Molecular dynamics ; PBD ; CPI ; CBI ; Seco-amino CI

刊名：Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

出版年：2017

2.Novel indolizino[8,7-b]indole hybrids as anti-small cell lung cancer agents: Regioselective modulation of topoisomerase II inhibitory and DNA crosslinking activities

作者：Sue-Ming Chang^a ; Wilson Christian^a ; ^b ; Ming-Hsi Wu^a ; Tai-Lin Chen^a ; ^c ; Yi-Wen Lin^a ; Ching-Shu Suen^a ; Hima Bindu Pidugu^a ; Dilip Detroja^a ; ^b ; Anamik Shah^b ; Ming-Jing Hwang^a ; Tsann-Long Su^a ; ^{tlsu@ibms.sinica.edu.tw} ; Te-Chang Lee^a ; ^{bmtcl@ibms.sinica.edu.tw}

关键词：Anti-SCLC hybrids ; β-carboline ; bis(hydroxymethyl)pyrrole ; indolizino[8 ; 7-b]indole ; DNA cross-linking ; Topoisomerase inhibition

刊名：European Journal of Medicinal Chemistry

出版年：2017

3.Interdomain Communication of the Chd1 Chromatin Remodeler across the DNA Gyres of the Nucleosome

作者：Ilana M. Nodelman¹ ; Franziska Bleichert² ; ³ ; Ashok Patel¹ ; ⁴ ; Ren Ren¹ ; Kyle C. Horvath¹ ; James M. Berger² ; Gregory D. Bowman¹ ; ⁵ ; ^{gdbowman@jhu.edu}

关键词：chromatin remodeling ; nucleosome sliding ; chromodomains ; SF2 ATPase ; superhelical location 2 ; SHL2 ; DNA unwrapping ; nucleosome assembly ; CHD remodeler ; ISWI remodeler

刊名：Molecular Cell

出版年：2017

4.Linking Chromatin Fibers to Gene Folding by Hierarchical Looping

作者：Gavin Bascom¹ ; Tamar Schlick¹ ; ² ; ³ ; ^{schlick@nyu.edu}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

5.Bifunctional alkylating agent-mediated MGMT-DNA cross-linking and its proteolytic cleavage in 16HBE cells

作者：Jin Cheng ; Feng Ye ; Guorong Dan ; Yuanpeng Zhao ; Bin Wang ; Jiqing Zhao ; Yan Sai ; Zhongmin Zou ; ^{zouzhmin@yahoo.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：MGMT ; DNA damage and repair ; DNA-protein cross-link ; Bifunctional alkylating agent ; Nitrogen mustard ; Proteolysis

刊名：Toxicology and Applied Pharmacology

出版年：2016

6.Synthesis and antitumor activity evaluation of a novel combi-nitrosourea prodrug: Designed to release a DNA cross-linking agent and an inhibitor of O⁶-alkylguanine-DNA alkyltransferase

作者：Guohui Sun ; Na Zhang ; Lijiao Zhao ; ^{zhaolijiao@bjut.edu.cn" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Tengjiao Fan ; Shufen Zhang ; Rugang Zhong

关键词：CENUs ; chloroethylnitrosoureas ; ACNU ; 1-[(4-amino-2-methyl-5-pyrimidinyl)methyl]-3-(2-chloroethyl)-3-nitrosourea ; BCNU ; 1 ; 3-bis(2-chloroethyl)-1-nitrosourea ; CCNU ; 1-(2-chloroethyl)-3-cyclohexyl-1-nitrosourea ; me-CCNU ; 1-(2-chloroethyl)-3-(4-methyl-cyclohexyl)-1-nitrosourea ; ICLs ; interstrand cross-links ; O6-ClEtdGuo ; O6-(2-chloroethyl)deoxyguanosine ; N1 ; O6-EtdGuo ; N1 ; O6-ethanodeoxyguanosine ; dGuo ; deoxyguanosine ; dCyd ; deoxycytidine ; AGT ; O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase ; Cys145 ; cysteine14

刊名：Bioorganic & Medicinal Chemistry

出版年：2016

7.Synthesis and evaluation of methylene blue oligonucleotide conjugates for DNA interstrand cross-linking

作者：Nathalie De Laet ; Annemieke Madder ; ^{Annemieke.madder@ugent.be" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：DNA interstrand cross-linking ; Singlet oxygen ; Photosensitization ; Methylene blue ; Oligonucleotide conjugates

刊名：Journal of Photochemistry & Photobiology, A: Chemistry

出版年：2016

8.Analogues of DNA minor groove cross-linking agents incorporating aminoCBI, an amino derivative of the duocarmycins: Synthesis, cytotoxicity, and potential as payloads for antibody-drug conjugates

作者：Anna C. Giddens^a ; Ho H. Lee^a ; Guo-Liang Lu^a ; Christian K. Miller^a ; Jun Guo^b ; Gail D. Lewis Phillips^b ; Thomas H. Pillow^b ; Moana Tercel^a ; ^{m.tercel@auckland.ac.nz" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：ADC ; antibody&ndash ; drug conjugate ; BINAP ; 2 ; 2&prime ; -bis(diphenylphosphino)-1 ; 1&prime ; -binaphthalene ; CBI ; 129 ; 9a-tetrahydrocyclopropa[c]benz[e]indol-4-one ; EDCI ; N-ethyl-N&prime ; -(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide hydrochloride ; MMAE ; monomethyl auristatin E ; PBD ; pyrrolobenzodiazepine ; Pgp ; P-glycoprotein

刊名：Bioorganic & Medicinal Chemistry

出版年：2016

9.Photoaffinity electrophoretic mobility shift assay using photoreactive DNA bearing 3-trifluoromethyl-3-phenyldiazirine in its phosphate backbone

作者：Yutaka Sadakane^a ; ^{sadapon@suzuka-u.ac.jp" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Yasumaru Hatanaka^b

关键词：Diazirine ; Octamer motif ; Phosphorothioate ; Photo-cross-linking ; Proteomic analysis

刊名：Analytical Biochemistry

出版年：2016

10.Linking DNA Damage and Hormone Signaling Pathways in Cancer

作者：Matthew J. Schiewer¹ ; ² ; Karen E. Knudsen¹ ; ² ; ³ ; ⁴ ; ^{karen.knudsen@jefferson.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：cancer ; hormones ; DNA repair ; transcription ; nuclear receptor

刊名：Trends in Endocrinology & Metabolism

出版年：2016

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