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1.High-resolution mapping of bifurcations in nonlinear biochemical circuits

作者：A. J. Genot ; A. Baccouche ; R. Sieskind ; N. Aubert-Kato ; N. Bredeche ; J. F. Bartolo ; V. Taly ; T. Fujii ; Y. Rondelez

关键词：DNA computing ; Microfluidics ; Biochemical reaction networks ; High-throughput screening ; DNA

刊名：Nature Chemistry

出版年：2016

2.Analyzing and interpreting genome data at the network level with ConsensusPathDB

作者：Ralf Herwig ; Christopher Hardt ; Matthias Lienhard ; Atanas Kamburov

关键词：Protein-protein interaction networks ; Biochemical networks ; Data integration ; Bioinformatics

刊名：Nature Protocols

出版年：2016

3.DNA reaction networks: Providing a panoramic view

作者：Fei Wang ; Chunhai Fan

关键词：Biophysical chemistry ; DNA

刊名：Nature Chemistry

出版年：2016

4.Metabolite concentrations, fluxes and free energies imply efficient enzyme usage

作者：Junyoung O Park ; Sara A Rubin ; Yi-Fan Xu ; Daniel Amador-Noguez ; Jing Fan ; Tomer Shlomi ; Joshua D Rabinowitz

关键词：Biochemical reaction networks ; Metabolomics ; Systems biology ; Mass spectrometry

刊名：Nature Chemical Biology

出版年：2016

5.An evolutionary game approach for determination of the structural conflicts in signed networks

作者：Shaolin Tan ; Jinhu Lü

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

6.Notes on stochastic (bio)-logic gates: computing with allosteric cooperativity

作者：Elena Agliari ; Matteo Altavilla ; Adriano Barra ; Lorenzo Dello Schiavo ; Evgeny Katz

关键词：Biochemical networks ; Computational biophysics ; Biophysical chemistry

刊名：Scientific Reports

出版年：2015

7.Computational prediction of microRNA networks incorporating environmental toxicity and disease etiology

作者：Jie Li ; Zengrui Wu ; Feixiong Cheng ; Weihua Li ; Guixia Liu ; Yun Tang

关键词：Biochemical reaction networks ; Computer science ; Risk factors ; Diseases

刊名：Scientific Reports

出版年：2014

8.Identifying anti-growth factors for human cancer cell lines through genome-scale metabolic modeling

作者：Pouyan Ghaffari ; Adil Mardinoglu ; Anna Asplund ; Saeed Shoaie ; Caroline Kampf ; Mathias Uhlen ; Jens Nielsen

关键词：Biochemical reaction networks ; Biochemical networks

刊名：Scientific Reports

出版年：2015

9.Protein-protein Interaction Networks of E. coli and S. cerevisiae are similar

作者：S. Wuchty ; Peter Uetz

关键词：Network topology ; Biochemical networks

刊名：Scientific Reports

出版年：2014

10.Amino Acid Flux from Metabolic Network Benefits Protein Translation: the Role of Resource Availability

作者：Xiao-Pan Hu ; Yi Yang ; Bin-Guang Ma

关键词：Biochemical reaction networks ; Translation ; Proteome ; Biochemical networks

刊名：Scientific Reports

出版年：2015

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