作者：Matthew D. Schultz ; Yupeng He ; John W. Whitaker ; Manoj Hariharan ; Eran A. Mukamel ; Danny Leung ; Nisha Rajagopal ; Joseph R. Nery ; Mark A. Urich ; Huaming Chen ; Shin Lin ; Yiing Lin ; Inkyung Jung ; Anthony D. Schmitt ; Siddarth Selvaraj ; Bing Ren ; Terrence J. Sejnowski ; Wei Wang ; Joseph R. Ecker

关键词：Epigenomics ; DNA methylation

刊名：Nature

出版年：2016

作者：Roadmap Epigenomics Consortium ; Anshul Kundaje ; Wouter Meuleman ; Jason Ernst ; Misha Bilenky ; Angela Yen ; Alireza Heravi-Moussavi ; Pouya Kheradpour ; Zhizhuo Zhang ; Jianrong Wang ; Michael J. Ziller ; Viren Amin ; John W. Whitaker ; Matthew D. Schultz ; Lucas D. Ward ; Abhishek Sarkar ; Gerald Quon ; Richard S. Sandstrom ; Matthew L. Eaton ; Yi-Chieh Wu ; Andreas R. Pfenning ; Xinchen Wang ; Melina Claussnitzer ; Yaping Liu ; Cristian Coarfa ; R. Alan Harris ; Noam Shoresh ; Charles B. Epstein ; Elizabeta Gjoneska ; Danny Leung ; Wei Xie ; R. David Hawkins ; Ryan Lister ; Chibo Hong ; Philippe Gascard ; Andrew J. Mungall ; Richard Moore ; Eric Chuah ; Angela Tam ; Theresa K. Canfield ; R. Scott Hansen ; Rajinder Kaul ; Peter J. Sabo ; Mukul S. Bansal ; Annaick Carles ; Jesse R. Dixon ; Kai-How Farh ; Soheil Feizi ; Rosa Karlic ; Ah-Ram Kim ; Ashwinikumar Kulkarni ; Daofeng Li ; Rebecca Lowdon ; GiNell Elliott ; Tim R. Mercer ; Shane J. Neph ; Vitor Onuchic ; Paz Polak ; Nisha Rajagopal ; Pradipta Ray ; Richard C. Sallari ; Kyle T. Siebenthall ; Nicholas A. Sinnott-Armstrong ; Michael Stevens ; Robert E. Thurman ; Jie Wu ; Bo Zhang ; Xin Zhou ; Arthur E. Beaudet ; Laurie A. Boyer ; Philip L. De Jager ; Peggy J. Farnham ; Susan J. Fisher ; David Haussler ; Steven J. M. Jones ; Wei Li ; Marco A. Marra ; Michael T. McManus ; Shamil Sunyaev ; James A. Thomson ; Thea D. Tlsty ; Li-Huei Tsai ; Wei Wang ; Robert A. Waterland ; Michael Q. Zhang ; Lisa H. Chadwick ; Bradley E. Bernstein ; Joseph F. Costello ; Joseph R. Ecker ; Martin Hirst ; Alexander Meissner ; Aleksandar Milosavljevic ; Bing Ren ; John A. Stamatoyannopoulos ; Ting Wang ; Manolis Kellis ; Roadmap Epigenomics Consortium

关键词：Epigenomics ; Data integration ; Regulatory networks ; Genome-wide association studies

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Guangxiang Chen ; Du Lei ; Jiechuan Ren ; Panli Zuo ; Xueling Suo ; Danny J. J. Wang ; Meiyun Wang ; Dong Zhou ; Qiyong Gong

刊名：Scientific Reports

出版年：2016

作者：Brian B Avants ; Jeffrey T Duda ; Emily Kilroy ; Kate Krasileva ; Kay Jann ; Benjamin T Kandel ; Nicholas J Tustison ; Lirong Yan ; Mayank Jog ; Robert Smith ; Yi Wang ; Mirella Dapretto ; Danny J J Wang

关键词：Brain imaging ; Magnetic resonance imaging ; Network models ; Paediatrics

刊名：Scientific Data

出版年：2015

作者：Peter H. Sudmant ; Tobias Rausch ; Eugene J. Gardner ; Robert E. Handsaker ; Alexej Abyzov ; John Huddleston ; Yan Zhang ; Kai Ye ; Goo Jun ; Markus Hsi-Yang Fritz ; Miriam K. Konkel ; Ankit Malhotra ; Adrian M. Stü ; tz ; Xinghua Shi ; Francesco Paolo Casale ; Jieming Chen ; Fereydoun Hormozdiari ; Gargi Dayama ; Ken Chen ; Maika Malig ; Mark J. P. Chaisson ; Klaudia Walter ; Sascha Meiers ; Seva Kashin ; Erik Garrison ; Adam Auton ; Hugo Y. K. Lam ; Xinmeng Jasmine Mu ; Can Alkan ; Danny Antaki ; Taejeong Bae ; Eliza Cerveira ; Peter Chines ; Zechen Chong ; Laura Clarke ; Elif Dal ; Li Ding ; Sarah Emery ; Xian Fan ; Madhusudan Gujral ; Fatma Kahveci ; Jeffrey M. Kidd ; Yu Kong ; Eric-Wubbo Lameijer ; Shane McCarthy ; Paul Flicek ; Richard A. Gibbs ; Gabor Marth ; Christopher E. Mason ; Androniki Menelaou ; Donna M. Muzny ; Bradley J. Nelson ; Amina Noor ; Nicholas F. Parrish ; Matthew Pendleton ; Andrew Quitadamo ; Benjamin Raeder ; Eric E. Schadt ; Mallory Romanovitch ; Andreas Schlattl ; Robert Sebra ; Andrey A. Shabalin ; Andreas Untergasser ; Jerilyn A. Walker ; Min Wang ; Fuli Yu ; Chengsheng Zhang ; Jing Zhang ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Wanding Zhou ; Thomas Zichner ; Jonathan Sebat ; Mark A. Batzer ; Steven A. McCarroll ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Ryan E. Mills ; Mark B. Gerstein ; Ali Bashir ; Oliver Stegle ; Scott E. Devine ; Charles Lee ; Evan E. Eichler ; Jan O. Korbel

关键词：Genomics ; Structural variation

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Matthew D. Schultz ; Yupeng He ; John W. Whitaker ; Manoj Hariharan ; Eran A. Mukamel ; Danny Leung ; Nisha Rajagopal ; Joseph R. Nery ; Mark A. Urich ; Huaming Chen ; Shin Lin ; Yiing Lin ; Inkyung Jung ; Anthony D. Schmitt ; Siddarth Selvaraj ; Bing Ren ; Terrence J. Sejnowski ; Wei Wang ; Joseph R. Ecker

关键词：Epigenomics ; DNA methylation

刊名：Nature

出版年：2015

作者：Olivier Delaneau ; Jonathan Marchini ; The 1000 Genomes Project Consortium ; Gil A. McVean ; Peter Donnelly ; Gerton Lunter ; Jonathan L. Marchini ; Simon Myers ; Anjali Gupta-Hinch ; Zamin Iqbal ; Iain Mathieson ; Andy Rimmer ; Dionysia K. Xifara ; Angeliki Kerasidou ; Claire Churchhouse ; Olivier Delaneau ; David M. Altshuler ; Stacey B. Gabriel ; Eric S. Lander ; Namrata Gupta ; < ; span class=' ; extra' ; > ; Mark J. Daly ; Mark A. DePristo ; Eric Banks ; Gaurav Bhatia ; Mauricio O. Carneiro ; Guillermo del Angel ; Giulio Genovese ; Robert E. Handsaker ; Chris Hart ; Steven A. McCarroll ; James C. Nemesh ; Ryan E. Poplin ; Stephen F. Schaffner ; Khalid Shakir ; Pardis C. Sabeti ; Sharon R. Grossman ; Shervin Tabrizi ; Ridhi Tariya ; Heng Li ; David Reich ; Richard M. Durbin ; Matthew E. Hurles ; Senduran Balasubramaniam ; John Burton ; Petr Danecek ; Thomas M. Keane ; Anja Kolb-Kokocinski ; Shane McCarthy ; James Stalker ; Michael Quail ; Qasim Ayub ; Yuan Chen ; Alison J. Coffey ; Vincenza Colonna ; Ni Huang ; Luke Jostins ; Aylwyn Scally ; Klaudia Walter ; Yali Xue ; Yujun Zhang ; Ben Blackburne ; Sarah J. Lindsay ; Zemin Ning ; Adam Frankish ; Jennifer Harrow ; Chris Tyler-Smith ; Gonalo R. Abecasis ; Hyun Min Kang ; Paul Anderson ; Tom Blackwell ; Fabio Busonero ; Christian Fuchsberger ; Goo Jun ; Andrea Maschio ; Eleonora Porcu ; Carlo Sidore ; Adrian Tan ; Mary Kate Trost ; David R. Bentley ; Russell Grocock ; Sean Humphray ; Terena James ; Zoya Kingsbury ; Markus Bauer ; R. Keira Cheetham ; Tony Cox ; Michael Eberle ; Lisa Murray ; Richard Shaw ; Aravinda Chakravarti ; Andrew G. Clark ; Alon Keinan ; Juan L. Rodriguez-Flores ; Francisco M. De La Vega ; Jeremiah Degenhardt ; Evan E. Eichler ; Paul Flicek ; Laura Clarke ; Rasko Leinonen ; Richard E. Smith ; Xiangqun Zheng-Bradley ; Kathryn Beal ; Fiona Cunningham ; Javier Herrero ; William M. McLaren ; Graham R. S. Ritchie ; Jonathan Barker ; Gavin Kelman ; Eugene Kulesha ; Rajesh Radhakrishnan ; Asier Roa ; Dmitriy Smirnov ; Ian Streeter ; Iliana Toneva ; Richard A. Gibbs ; Huyen Dinh ; Christie Kovar ; Sandra Lee ; Lora Lewis ; Donna Muzny ; Jeff Reid ; Min Wang ; Fuli Yu ; Matthew Bainbridge ; Danny Challis ; Uday S. Evani ; James Lu ; Uma Nagaswamy ; Aniko Sabo ; Yi Wang ; Jin Yu ; Gerald Fowler ; Walker Hale ; Divya Kalra ; Eric D. Green ; Bartha M. Knoppers ; Jan O. Korbel ; Tobias Rausch ; Adrian M. Sttz ; Charles Lee ; Lauren Griffin ; Chih-Heng Hsieh ; Ryan E. Mills ; Marcin von Grotthuss ; Chengsheng Zhang ; Xinghua Shi ; Hans Lehrach ; Ralf Sudbrak ; Vyacheslav S. Amstislavskiy ; Matthias Lienhard ; Florian Mertes ; Marc Sultan ; Bernd Timmermann ; Marie-Laure Yaspo ; Sudbrak ; Ralf Herwig ; Elaine R. Mardis ; Richard K. Wilson ; Lucinda Fulton ; Robert Fulton ; George M. Weinstock ; Asif Chinwalla ; Li Ding ; David Dooling ; Daniel C. Koboldt ; Michael D. McLellan ; John W. Wallis ; Michael C. Wendl ; Qunyuan Zhang ; Gabor T. Marth ; Erik P. Garrison ; Deniz Kural ; Wan-Ping Lee ; Wen Fung Leong ; Alistair N. Ward ; Jiantao Wu ; Mengyao Zhang ; Deborah A. Nickerson ; Can Alkan ; Fereydoun Hormozdiari ; Arthur Ko ; Peter H. Sudmant ; Jeanette P. Schmidt ; Christopher J. Davies ; Jeremy Gollub ; Teresa Webster ; Brant Wong ; Yiping Zhan ; Stephen T. Sherry ; Chunlin Xiao ; Deanna Church ; Victor Ananiev ; Zinaida Belaia ; Dimitriy Beloslyudtsev ; Nathan Bouk ; Chao Chen ; Robert Cohen ; Charles Cook ; John Garner ; Timothy Hefferon ; Mikhail Kimelman ; Chunlei Liu ; John Lopez ; Peter Meric ; Yuri Ostapchuk ; Lon Phan ; Sergiy Ponomarov ; Valerie Schneider ; Eugene Shekhtman ; Karl Sirotkin ; Douglas Slotta ; Hua Zhang ; Jun Wang ; Xiaodong Fang ; Xiaosen Guo ; Min Jian ; Hui Jiang ; Xin Jin ; Guoqing Li ; Jingxiang Li ; Yingrui Li ; Xiao Liu ; Yao Lu ; Xuedi Ma ; Shuaishuai Tai ; Meifang Tang ; Bo Wang ; Guangbiao Wang ; Honglong Wu ; Renhua Wu ; Ye Yin ; Wenwei Zhang ; Jiao Zhao ; Meiru Zhao ; Xiaole Zheng ; Lachlan J.M. Coin ; Lin Fang ; Qibin Li ; Zhenyu Li ; Haoxiang Lin ; Binghang Liu ; Ruibang Luo ; Haojing Shao ; Bingqiang Wang ; Yinlong Xie ; Chen Ye ; Chang Yu ; Hancheng Zheng ; Hongmei Zhu ; Hongyu Cai ; Hongzhi Cao ; Yeyang Su ; Zhongming Tian ; Huanming Yang ; Ling Yang ; Jiayong Zhu ; Zhiming Cai ; Jian Wang ; Marcus W. Albrecht ; Tatiana A. Borodina ; Adam Auton ; Seungtai C. Yoon ; Jayon Lihm ; Vladimir Makarov ; Hanjun Jin ; Wook Kim ; Ki Cheol Kim ; Srikanth Gottipati ; Danielle Jones ; David N. Cooper ; Edward V. Ball ; Peter D. Stenson ; Bret Barnes ; Scott Kahn ; Kai Ye ; Mark A. Batzer ; Miriam K. Konkel ; Jerilyn A. Walker ; Daniel G. MacArthur ; Monkol Lek ; Mark D. Shriver ; Carlos D. Bustamante ; Simon Gravel ; Eimear E. Kenny ; Jeffrey M. Kidd ; Phil Lacroute ; Brian K. Maples ; Andres Moreno-Estrada ; Fouad Zakharia ; Brenna Henn ; Karla Sandoval ; Jake K. Byrnes ; Eran Halperin ; Yael Baran ; David W. Craig ; Alexis Christoforides ; Tyler Izatt ; Ahmet A. Kurdoglu ; Shripad A. Sinari ; Nils Homer ; Kevin Squire ; Jonathan Sebat ; Vineet Bafna ; Kenny Ye ; Esteban G. Burchard ; Ryan D. Hernandez ; Christopher R. Gignoux ; David Haussler ; Sol J. Katzman ; W. James Kent ; Bryan Howie ; Andres Ruiz-Linares ; Emmanouil T. Dermitzakis ; Tuuli Lappalainen ; Scott E. Devine ; Xinyue Liu ; Ankit Maroo ; Luke J. Tallon ; Jeffrey A. Rosenfeld ; Leslie P. Michelson ; Andrea Angius ; Francesco Cucca ; Serena Sanna ; Abigail Bigham ; Chris Jones ; Fred Reinier ; Yun Li ; Robert Lyons ; David Schlessinger ; Philip Awadalla ; Alan Hodgkinson ; Taras K. Oleksyk ; Juan C. Martinez-Cruzado ; Yunxin Fu ; Xiaoming Liu ; Momiao Xiong ; Lynn Jorde ; David Witherspoon ; Jinchuan Xing ; Brian L. Browning ; Iman Hajirasouliha ; Ken Chen ; Cornelis A. Albers ; Mark B. Gerstein ; Alexej Abyzov ; Jieming Chen ; Yao Fu ; Lukas Habegger ; Arif O. Harmanci ; Xinmeng Jasmine Mu ; Cristina Sisu ; Suganthi Balasubramanian ; Mike Jin ; Ekta Khurana ; Declan Clarke ; Jacob J. Michaelson ; Chris OSullivan ; Kathleen C. Barnes ; Neda Gharani ; Lorraine H. Toji ; Norman Gerry ; Jane S. Kaye ; Alastair Kent ; Rasika Mathias ; Pilar N. Ossorio ; Michael Parker ; Charles N. Rotimi ; Charmaine D. Royal ; Sarah Tishkoff ; Marc Via ; Walter Bodmer ; Gabriel Bedoya ; Gao Yang ; Chu Jia You ; Andres Garcia-Montero ; Alberto Orfao ; Julie Dutil ; Lisa D. Brooks ; Adam L. Felsenfeld ; Jean E. McEwen ; Nicholas C. Clemm ; Mark S. Guyer ; Jane L. Peterson ; Audrey Duncanson ; Michael Dunn ; Leena Peltonenz

刊名：Nature Communications

出版年：2014

作者：Jingshan Ren ; Xiangxi Wang ; Zhongyu Hu ; Qiang Gao ; Yao Sun ; Xuemei Li ; Claudine Porta ; Thomas S. Walter ; Robert J. Gilbert ; Yuguang Zhao ; Danny Axford ; Mark Williams ; Katherine McAuley ; David J. Rowlands ; Weidong Yin ; Junzhi Wang ; David I. Stuart ; Zihe Rao ; Elizabeth E. Fry

刊名：Nature Communications

出版年：2013

作者：Andrew H. Paterson ; Jonathan F. Wendel ; Heidrun Gundlach ; Hui Guo ; Jerry Jenkins ; Dianchuan Jin ; Danny Llewellyn ; Kurtis C. Showmaker ; Shengqiang Shu ; Joshua Udall ; Mi-jeong Yoo ; Robert Byers ; Wei Chen ; Adi Doron-Faigenboim ; Mary V. Duke ; Lei Gong ; Jane Grimwood ; Corrinne Grover ; Kara Grupp ; Guanjing Hu ; Tae-ho Lee ; Jingping Li ; Lifeng Lin ; Tao Liu ; Barry S. Marler ; Justin T. Page ; Alison W. Roberts ; Elisson Romanel ; William S. Sanders ; Emmanuel Szadkowski ; Xu Tan ; Haibao Tang ; Chunming Xu ; Jinpeng Wang ; Zining Wang ; Dong Zhang ; Lan Zhang ; Hamid Ashrafi ; Frank Bedon ; John E. Bowers ; Curt L. Brubaker ; Peng W. Chee ; Sayan Das ; Alan R. Gingle ; Candace H. Haigler ; David Harker ; Lucia V. Hoffmann ; Ran Hovav ; Donald C. Jones ; Cornelia Lemke ; Shahid Mansoor ; Mehboob ur Rahman ; Lisa N. Rainville ; Aditi Rambani ; Umesh K. Reddy ; Jun-kang Rong ; Yehoshua Saranga ; Brian E. Scheffler ; Jodi A. Scheffler ; David M. Stelly ; Barbara A. Triplett ; Allen Van Deynze ; Maite F. S. Vaslin ; Vijay N. Waghmare ; Sally A. Walford ; Robert J. Wright ; Essam A. Zaki ; Tianzhen Zhang ; Elizabeth S. Dennis ; Klaus F. X. Mayer ; Daniel G. Peterson ; Daniel S. Rokhsar ; Xiyin Wang ; Jeremy Schmutz

关键词：Evolutionary biology

刊名：Nature

出版年：2012

作者：Ray Ming ; Shaobin Hou ; Yun Feng ; Qingyi Yu ; Alexandre Dionne-Laporte ; Jimmy H. Saw ; Pavel Senin ; Wei Wang ; Benjamin V. Ly ; Kanako L. T. Lewis ; Steven L. Salzberg ; Lu Feng ; Meghan R. Jones ; Rachel L. Skelton ; Jan E. Murray ; Cuixia Chen ; Wubin Qian ; Junguo Shen ; Peng Du ; Moriah Eustice ; Eric Tong ; Haibao Tang ; Eric Lyons ; Robert E. Paull ; Todd P. Michael ; Kerr Wall ; Danny W. Rice ; Henrik Albert ; Ming-Li Wang ; Yun J. Zhu ; Michael Schatz ; Niranjan Nagarajan ; Ricelle A. Acob ; Peizhu Guan ; Andrea Blas ; Ching Man Wai ; Christine M. Ackerman ; Yan Ren ; Chao Liu ; Jianmei Wang ; Jianping Wang ; Jong-Kuk Na ; Eugene V. Shakirov ; Brian Haas ; Jyothi Thimmapuram ; David Nelson ; Xiyin Wang ; John E. Bowers ; Andrea R. Gschwend ; Arthur L. Delcher ; Ratnesh Singh ; Jon Y. Suzuki ; Savarni Tripathi ; Kabi Neupane ; Hairong Wei ; Beth Irikura ; Maya Paidi ; Ning Jiang ; Wenli Zhang ; Gernot Presting ; Aaron Windsor ; Rafael Navajas-Pé ; rez ; Manuel J. Torres ; F. Alex Feltus ; Brad Porter ; Yingjun Li ; A. Max Burroughs ; Ming-Cheng Luo ; Lei Liu ; David A. Christopher ; Stephen M. Mount ; Paul H. Moore ; Tak Sugimura ; Jiming Jiang ; Mary A. Schuler ; Vikki Friedman ; Thomas Mitchell-Olds ; Dorothy E. Shippen ; Claude W. dePamphilis ; Jeffrey D. Palmer ; Michael Freeling ; Andrew H. Paterson ; Dennis Gonsalves ; Lei Wang ; Maqsudul Alam

刊名：Nature

出版年：2008