作者：Boris Novakovic¹ ; ⁷ ; Ehsan Habibi¹ ; ⁷ ; Shuang-Yin Wang¹ ; ⁷ ; Rob J.W. Arts² ; Robab Davar¹ ; Wout Megchelenbrink¹ ; Bowon Kim¹ ; Tatyana Kuznetsova¹ ; Matthijs Kox³ ; Jelle Zwaag³ ; Filomena Matarese¹ ; Simon J. van Heeringen⁴ ; Eva M. Janssen-Megens¹ ; Nilofar Sharifi¹ ; Cheng Wang¹ ; Farid Keramati¹ ; Vivien Schoonenberg¹ ; Paul Flicek⁵ ; Laura Clarke⁵ ; Peter Pickkers³ ; Simon Heath⁶ ; Ivo Gut⁶ ; Mihai G. Netea² ; Joost H.A. Martens¹ ; Colin Logie¹ ; Hendrik G. Stunnenberg¹ ; ⁸ ; ^{h.stunnenberg@ncmls.ru.nl" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：epigenome ; transcriptome ; trained innate immunity ; endotoxin tolerance ; histone modifications ; human monocytes ; macrophages ; β-glucan ; lipopolysaccharide ; BLUEPRINT

刊名：Cell

出版年：2016

作者：Biola M. Javierre¹ ; ¹¹ ; Oliver S. Burren² ; ¹¹ ; Steven P. Wilder³ ; ¹¹ ; Roman Kreuzhuber³ ; ⁴ ; ⁵ ; ¹¹ ; Steven M. Hill⁶ ; ¹¹ ; Sven Sewitz¹ ; Jonathan Cairns¹ ; Steven W. Wingett¹ ; Csilla Vá ; rnai¹ ; Michiel J. Thiecke¹ ; Frances Burden⁴ ; ⁵ ; Samantha Farrow⁴ ; ⁵ ; Antony J. Cutler² ; Karola Rehnströ ; m⁴ ; ⁵ ; Kate Downes⁴ ; ⁵ ; Luigi Grassi⁴ ; ⁵ ; Myrto Kostadima³ ; ⁴ ; ⁵ ; Paula Freire-Pritchett¹ ; Fan Wang⁶ ; The BLUEPRINT Consortium Joost H. Martens ; Bowon Kim ; Nilofar Sharifi ; Eva M. Janssen-Megens ; Marie-Laure Yaspo ; Matthias Linser ; Alexander Kovacsovics ; Laura Clarke ; David Richardson ; Avik Datta ; Paul Flicek

关键词：gene regulation ; chromosome conformation ; promoter capture Hi-C ; non-coding genetic variation ; disease gene prioritization

刊名：Cell

出版年：2016

作者：Christopher J. Tynan ; Valentina Lo Schiavo ; Laura Zanetti-Domingues ; Sarah R. Needham ; Selene K. Roberts ; Michael Hirsch ; Daniel J. Rolfe ; Dimitrios Korovesis ; David T. Clarke ; Marisa L. Martin-Fernandez ; ^{marisa.martin-fernandez@stfc.ac.uk" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：EGFR ; Membrane protein structure ; Signal transduction ; Receptor tyrosine kinase ; FRET ; Super-resolution microscopy ; Single molecule fluorescence microscopy

刊名：Methods

出版年：2016

作者：Ronald P. Schuyler¹ ; ² ; Angelika Merkel¹ ; ² ; Emanuele Raineri¹ ; ² ; Lucia Altucci³ ; Edo Vellenga⁴ ; Joost H.A. Martens⁵ ; Farzin Pourfarzad⁶ ; Taco W. Kuijpers⁶ ; ⁷ ; Frances Burden⁸ ; ⁹ ; Samantha Farrow⁸ ; ⁹ ; Kate Downes⁸ ; ⁹ ; Willem H. Ouwehand⁸ ; ⁹ ; ¹⁰ ; ¹¹ ; Laura Clarke¹² ; Avik Datta¹² ; Ernesto Lowy¹² ; Paul Flicek¹² ; Mattia Frontini⁸ ; ⁹ ; ¹⁰ ; Hendrik G. Stunnenberg⁵ ; José ; I. Martí ; n-Subero¹³ ; Ivo Gut¹ ; ² ; Simon Heath¹ ; ² ; ¹⁴ ; ^{simon.heath@gmail.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：DNA methylation ; epigenetics ; whole-genome bisulfite sequencing ; hematopoiesis ; CTCF ; nucleosomes ; BLUEPRINT

刊名：Cell Reports

出版年：2016

作者：Hendrik G. Stunnenberg¹ ; ^{h.stunnenberg@ncmls.ru.nl" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; The International Human Epigenome Consortium⁴ ; Sergio Abrignani ; David Adams ; Melanie de Almeida ; Lucia Altucci ; Viren Amin ; Ido Amit ; Stylianos E. Antonarakis ; Samuel Aparicio ; Takahiro Arima ; Laura Arrigoni ; Rob Arts ; Vahid Asnafi ; Manel Esteller Badosa ; Jae-Bum Bae ; Kevin Bassler ; Stephan Beck ; Benjamin Berkman ; Bradley E. Bernstein ; Mikhail Bilenky ; Adrian Bird ; Christoph Bock ; Bernhard Boehm ; Guillaume Bourque ; Charles E. Breeze ; Benedikt Brors ; David Bujold ; Oliver Burren ; Marion J. Bussemakers ; Adam Butterworth ; Elias Campo ; Enrique Carrillo-de-Santa-Pau ; Lisa Chadwick ; Kui Ming Chan ; Wei Chen ; Tom H. Cheung ; Luca Chiapperino ; Nak Hyen Choi ; Ho-Ryun Chung ; Laura Clarke ; Joseph M. Connors ; Philippe Cronet ; John Danesh ; Manolis Dermitzakis ; Gerard Drewes ; Pawel Durek ; Stephanie Dyke ; Tomasz Dylag ; Connie J. Eaves ; Peter Ebert ; Roland Eils ; Jü ; rgen Eils ; Catherine A. Ennis ; Tariq Enver ; Elise A. Feingold ; Bä ; rbel Felder ; Anne Ferguson-Smith ; Jude Fitzgibbon ; Paul Flicek ; Roger S.-Y. Foo ; Peter Fraser ; Mattia Frontini ; Eileen Furlong ; Sitanshu Gakkhar ; Nina Gasparoni ; Gilles Gasparoni ; Daniel H. Geschwind ; Petar Glažar ; Thomas Graf ; Frank Grosveld ; Xin-Yuan Guan ; Roderic Guigo ; Ivo G. Gut ; Alf Hamann ; Bok-Ghee Han ; R. Alan Harris ; Simon Heath ; Kristian Helin ; Jan G. Hengstler ; Alireza Heravi-Moussavi ; Karl Herrup ; Steven Hill ; Jason A. Hilton ; Benjamin C. Hitz ; Bernhard Horsthemke ; Ming Hu ; Joo-Yeon Hwang ; Nancy Y. Ip ; Takashi Ito ; Biola-Maria Javierre ; Sasa Jenko ; Thomas Jenuwein ; Yann Joly ; Steven J.M. Jones ; Yae Kanai ; Hee Gyung Kang ; Aly Karsan ; Alexandra K. Kiemer ; Song Cheol Kim ; Bong-Jo Kim ; Hyeon-Hoe Kim ; Hiroshi Kimura ; Sarah Kinkley ; Filippos Klironomos ; In-Uk Koh ; Myrto Kostadima ; Christopher Kressler ; Roman Kreuzhuber ; Anshul Kundaje ; Ralf Kü ; ppers ; Carolyn Larabell ; Paul Lasko ; Mark Lathrop ; Daniel H.S. Lee ; Suman Lee ; Hans Lehrach ; Elsa Leitão ; Thomas Lengauer ; Å ; ke Lernmark ; R. David Leslie ; Gilberto K.K. Leung ; Danny Leung ; Markus Loeffler ; Yussanne Ma ; Antonello Mai ; Thomas Manke ; Eric R. Marcotte ; Marco A. Marra ; Joost H.A. Martens ; Jose Ignacio Martin-Subero ; Karen Maschke ; Christoph Merten ; Aleksandar Milosavljevic ; Saverio Minucci ; Totai Mitsuyama ; Richard A. Moore ; Fabian Mü ; ller ; Andrew J. Mungall ; Mihai G. Netea ; Karl Nordström ; Irene Norstedt ; Hiroaki Okae ; Vitor Onuchic ; Francis Ouellette ; Willem Ouwehand ; Massimiliano Pagani ; Vera Pancaldi ; Thomas Pap ; Tomi Pastinen ; Ronak Patel ; Dirk S. Paul ; Michael J. Pazin ; Pier Giuseppe Pelicci ; Anthony G. Phillips ; Julia Polansky ; Bo Porse ; J. Andrew Pospisilik ; Shyam Prabhakar ; Dena C. Procaccini ; Andreas Radbruch ; Nikolaus Rajewsky ; Vardham Rakyan ; Wolf Reik ; Bing Ren ; David Richardson ; Andreas Richter ; Daniel Rico ; David J. Roberts ; Philip Rosenstiel ; Mark Rothstein ; Abdulrahman Salhab ; Hiroyuki Sasaki ; John S. Satterlee ; Sascha Sauer ; Claudia Schacht ; Florian Schmidt ; Gerd Schmitz ; Stefan Schreiber ; Christopher Schrö ; der ; Dirk Schü ; beler ; Joachim L. Schultze ; Ronald P. Schulyer ; Marcel Schulz ; Martin Seifert ; Katsuhiko Shirahige ; Reiner Siebert ; Thomas Sierocinski ; Laura Siminoff ; Anupam Sinha ; Nicole Soranzo ; Salvatore Spicuglia ; Mikhail Spivakov ; Christian Steidl ; J. Seth Strattan ; Michael Stratton ; Peter Sü ; dbeck ; Hao Sun ; Narumi Suzuki ; Yutaka Suzuki ; Amos Tanay ; David Torrents ; Frederick L. Tyson ; Thomas Ulas ; Sebastian Ullrich ; Toshikazu Ushijima ; Alfonso Valencia ; Edo Vellenga ; Martin Vingron ; Chris Wallace ; Stefan Wallner ; Jö ; rn Walter ; Huating Wang ; Stephanie Weber ; Nina Weiler ; Andreas Weller ; Andrew Weng ; Steven Wilder ; Sam M. Wiseman ; Angela R. Wu ; Zhenguo Wu ; Jieyi Xiong ; Yasuhiro Yamashita ; Xinyi Yang ; Desmond Y. Yap ; Kevin Y. Yip ; Stephen Yip ; Jae-Il Yoo ; Daniel Zerbino ; Gideon Zipprich

刊名：Cell

出版年：2016

作者：Ye Zhang¹ ; ⁷ ; ^{zhangye@stanford.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Steven A. Sloan¹ ; ⁷ ; Laura E. Clarke¹ ; Christine Caneda¹ ; Colton A. Plaza¹ ; Paul D. Blumenthal² ; Hannes Vogel³ ; Gary K. Steinberg⁴ ; Michael S.B. Edwards⁴ ; Gordon Li⁴ ; John A. Duncan III⁵ ; Samuel H. Cheshier⁴ ; Lawrence M. Shuer⁴ ; Edward F. Chang⁶ ; Gerald A. Grant⁴ ; Melanie G. Hayden Gephart⁴ ; Ben A. Barres¹

刊名：Neuron

出版年：2016

作者：Mustafa Sahin ; MD ; PhD^a ; ^{mustafa.sahin@childrens.harvard.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Elizabeth P. Henske ; MD^b ; Brendan D. Manning ; PhD^c ; Kevin C. Ess ; MD ; PhD^d ; John J. Bissler ; MD^e ; Eric Klann ; PhD^f ; David J. Kwiatkowski ; MD ; PhD^b ; Steven L. Roberds ; PhD^g ; Alcino J. Silva ; PhD^h ; Coryse St. Hillaire-Clarke ; PhDⁱ ; Lisa R. Young ; MD^j ; ^k ; Mark Zervas ; PhD^l ; Laura A. Mamounas ; PhDⁱ ; ^{mamounas@ninds.nih.gov" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; on behalf of the Tuberous Sclerosis Complex Working Group to Update the Research PlanJohn Blenis ; PhD^m ; Thomas N. Darling ; MD ; PhDⁿ ; Vera P. Krymskaya ; PhD ; MBA^o ; Joel Moss ; MD ; PhD^p ; Elahna Paul ; MD ; PhD^q ; Mario Pende ; PhD^r ; ^s ; ^t ; ^u ; ^v ; ^w ; Minkyung H. Song ; PhD^x ; Andrew J. Wagner ; MD ; PhD^y ; Anna W. Byars ; PhD^z ; Diane C. Chugani ; PhD^aa ; Gabriella D'Arcangelo ; PhD^bb ; Petrus J. de Vries ; MD^cc ; Michael J. Gambello ; MD ; PhD^dd ; Wendy B. Macklin ; PhD^ee ; Charles A. Nelson ; PhD^ff ; ^gg ; E. Martina Bebin ; MD ; MPA^hh ; Peter B. Crino ; MD ; PhDⁱⁱ ; David Franz ; MD^jj ; Brandy E. Fureman ; PhD^kk ; Henrik Klitgaard ; PhD^ll ; Darcy Krueger ; MD ; PhD^mm ; Elizabeth Thiele ; MD ; PhDⁿⁿ ; Howard L. Weiner ; MD^oo ; Michael Wong ; MD ; PhD^pp ; Joyce Y. Wu ; MD^qq ; Karen Cichowski ; PhD^rr ; ^ss ; ^tt ; Channing Der ; PhD^uu ; Leon O. Murphy ; PhD^vv ; Mark Nellist ; PhD^ww ; Hope Northrup ; MD^xx ; Norbert Perrimon ; PhD^yy ; Kari Luther Rosbeck^zz ; Reuben J. Shaw ; PhD^aaa ; Cara Long ; PhD^bbb ; Heather Rieff ; PhD^ccc

刊名：Pediatric Neurology

出版年：2016

作者：Pankaj J. Pasricha ; Madhusudan Grover ; Katherine P. Yates ; Cheryl Bernard ; Laura A. Miriel ; John O. Clarke ; Ellen M. Stein ; Sameer Dhalla ; Kenneth L. Koch ; William L. Hasler ; Richard W. McCallum ; Irene Sarosiek ; William J. Snape ; Linda Anh B. Nguyen ; James Tonascia ; Frank A. Hamilton ; Henry P. Parkman ; Thomas L. Abell ; Gianrico Farrugia

刊名：Gastroenterology

出版年：2016

作者：William L. Hasler ; Kevin P. May ; Pankaj J. Pasricha ; Henry P. Parkman ; Thomas L. Abell ; Kenneth L. Koch ; Richard W. McCallum ; Linda Anh B. Nguyen ; William J. Snape ; Irene Sarosiek ; John O. Clarke ; Gianrico Farrugia ; Jorge Calles-Escandon ; James Tonascia ; Laura Miriel ; Linda A. Lee ; Frank A. Hamilton

刊名：Gastroenterology

出版年：2016

作者：The Cancer Genome Atlas Research Network¹ ; ; ^{schultz@cbio.mskcc.org" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; ^{massimo_loda@dfci.harvard.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; ^{sander.research@gmail.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}Adam Abeshouse ; Jaeil Ahn ; Rehan Akbani ; Adrian Ally ; Samirkumar Amin ; Christopher D. Andry ; Matti Annala ; Armen Aprikian ; Joshua Armenia ; Arshi Arora ; J. Todd Auman ; Miruna Balasundaram ; Saianand Balu ; Christopher E. Barbieri ; Thomas Bauer ; Christopher C. Benz ; Alain Bergeron ; Rameen Beroukhim ; Mario Berrios ; Adrian Bivol ; Tom Bodenheimer ; Lori Boice ; Moiz S. Bootwalla ; Rodolfo Borges dos Reis ; Paul C. Boutros ; Jay Bowen ; Reanne Bowlby ; Jeffrey Boyd ; Robert K. Bradley ; Anne Breggia ; Fadi Brimo ; Christopher A. Bristow ; Denise Brooks ; Bradley M. Broom ; Alan H. Bryce ; Glenn Bubley ; Eric Burks ; Yaron S.N. Butterfield ; Michael Button ; David Canes ; Carlos G. Carlotti ; Rebecca Carlsen ; Michel Carmel ; Peter R. Carroll ; Scott L. Carter ; Richard Cartun ; Brett S. Carver ; June M. Chan ; Matthew T. Chang ; Yu Chen ; Andrew D. Cherniack ; Simone Chevalier ; Lynda Chin ; Juok Cho ; Andy Chu ; Eric Chuah ; Sudha Chudamani ; Kristian Cibulskis ; Giovanni Ciriello ; Amanda Clarke ; Matthew R. Cooperberg ; Niall M. Corcoran ; Anthony J. Costello ; Janet Cowan ; Daniel Crain ; Erin Curley ; Kerstin David ; John A. Demchok ; Francesca Demichelis ; Noreen Dhalla ; Rajiv Dhir ; Alexandre Doueik ; Bettina Drake ; Heidi Dvinge ; Natalya Dyakova ; Ina Felau ; Martin L. Ferguson ; Scott Frazer ; Stephen Freedland ; Yao Fu ; Stacey B. Gabriel ; Jianjiong Gao ; Johanna Gardner ; Julie M. Gastier-Foster ; Nils Gehlenborg ; Mark Gerken ; Mark B. Gerstein ; Gad Getz ; Andrew K. Godwin ; Anuradha Gopalan ; Markus Graefen ; Kiley Graim ; Thomas Gribbin ; Ranabir Guin ; Manaswi Gupta ; Angela Hadjipanayis ; Syed Haider ; Lucie Hamel ; D. Neil Hayes ; David I. Heiman ; Julian Hess ; Katherine A. Hoadley ; Andrea H. Holbrook ; Robert A. Holt ; Antonia Holway ; Christopher M. Hovens ; Alan P. Hoyle ; Mei Huang ; Carolyn M. Hutter ; Michael Ittmann ; Lisa Iype ; Stuart R. Jefferys ; Corbin D. Jones ; Steven J.M. Jones ; Hartmut Juhl ; Andre Kahles ; Christopher J. Kane ; Katayoon Kasaian ; Michael Kerger ; Ekta Khurana ; Jaegil Kim ; Robert J. Klein ; Raju Kucherlapati ; Louis Lacombe ; Marc Ladanyi ; Phillip H. Lai ; Peter W. Laird ; Eric S. Lander ; Mathieu Latour ; Michael S. Lawrence ; Kevin Lau ; Tucker LeBien ; Darlene Lee ; Semin Lee ; Kjong-Van Lehmann ; Kristen M. Leraas ; Ignaty Leshchiner ; Robert Leung ; John A. Libertino ; Tara M. Lichtenberg ; Pei Lin ; W. Marston Linehan ; Shiyun Ling ; Scott M. Lippman ; Jia Liu ; Wenbin Liu ; Lucas Lochovsky ; Massimo Loda ; Christopher Logothetis ; Laxmi Lolla ; Teri Longacre ; Yiling Lu ; Jianhua Luo ; Yussanne Ma ; Harshad S. Mahadeshwar ; David Mallery ; Armaz Mariamidze ; Marco A. Marra ; Michael Mayo ; Shannon McCall ; Ginette McKercher ; Shaowu Meng ; Anne-Marie Mes-Masson ; Maria J. Merino ; Matthew Meyerson ; Piotr A. Mieczkowski ; Gordon B. Mills ; Kenna R. Mills Shaw ; Sarah Minner ; Alireza Moinzadeh ; Richard A. Moore ; Scott Morris ; Carl Morrison ; Lisle E. Mose ; Andrew J. Mungall ; Bradley A. Murray ; Jerome B. Myers ; Rashi Naresh ; Joel Nelson ; Mark A. Nelson ; Peter S. Nelson ; Yulia Newton ; Michael S. Noble ; Houtan Noushmehr ; Matti Nykter ; Angeliki Pantazi ; Michael Parfenov ; Peter J. Park ; Joel S. Parker ; Joseph Paulauskis ; Robert Penny ; Charles M. Perou ; Alain Piché ; Todd Pihl ; Peter A. Pinto ; Davide Prandi ; Alexei Protopopov ; Nilsa C. Ramirez ; Arvind Rao ; W. Kimryn Rathmell ; Gunnar Rä ; tsch ; Xiaojia Ren ; Victor E. Reuter ; Sheila M. Reynolds ; Suhn K. Rhie ; Kimberly Rieger-Christ ; Jeffrey Roach ; A. Gordon Robertson ; Brian Robinson ; Mark A. Rubin ; Fred Saad ; Sara Sadeghi ; Gordon Saksena ; Charles Saller ; Andrew Salner ; Francisco Sanchez-Vega ; Chris Sander ; George Sandusky ; Guido Sauter ; Andrea Sboner ; Peter T. Scardino ; Eleonora Scarlata ; Jacqueline E. Schein ; Thorsten Schlomm ; Laura S. Schmidt ; Nikolaus Schultz ; Steven E. Schumacher ; Jonathan Seidman ; Luciano Neder ; Sahil Seth ; Alexis Sharp ; Candace Shelton ; Troy Shelton ; Hui Shen ; Ronglai Shen ; Mark Sherman ; Margi Sheth ; Yan Shi ; Juliann Shih ; Ilya Shmulevich ; Jeffry Simko ; Ronald Simon ; Janae V. Simons ; Payal Sipahimalani ; Tara Skelly ; Heidi J. Sofia ; Matthew G. Soloway ; Xingzhi Song ; Andrea Sorcini ; Carrie Sougnez ; Serghei Stepa ; Chip Stewart ; John Stewart ; Joshua M. Stuart ; Travis B. Sullivan ; Charlie Sun ; Huandong Sun ; Angela Tam ; Donghui Tan ; Jiabin Tang ; Roy Tarnuzzer ; Katherine Tarvin ; Barry S. Taylor ; Patrick Teebagy ; Imelda Tenggara ; Bernard Tê ; tu ; Ashutosh Tewari ; Nina Thiessen ; Timothy Thompson ; Leigh B. Thorne ; Daniela P. Tirapelli ; Scott A. Tomlins ; Felipe Amstalden Trevisan ; Patricia Troncoso ; Lawrence D. True ; Maria Christina Tsourlakis ; Svitlana Tyekucheva ; Eliezer Van Allen ; David J. Van Den Berg ; Umadevi Veluvolu ; Roel Verhaak ; Cathy D. Vocke ; Doug Voet ; Yunhu Wan ; Qingguo Wang ; Wenyi Wang ; Zhining Wang ; Nils Weinhold ; John N. Weinstein ; Daniel J. Weisenberger ; Matthew D. Wilkerson ; Lisa Wise ; John Witte ; Chia-Chin Wu ; Junyuan Wu ; Ye Wu ; Andrew W. Xu ; Shalini S. Yadav ; Liming Yang ; Lixing Yang ; Christina Yau ; Huihui Ye ; Peggy Yena ; Thomas Zeng ; Jean C. Zenklusen ; Hailei Zhang ; Jianhua Zhang ; Jiashan Zhang ; Wei Zhang ; Yi Zhong ; Kelsey Zhu ; Erik Zmuda

刊名：Cell

出版年：2015