作者：Michele Ceccarelli<sup>1sup><sup> ; sup><sup>2sup><sup> ; sup><sup>24sup> ; Floris P. Barthel<sup>3sup><sup> ; sup><sup>4sup><sup> ; sup><sup>24sup> ; Tathiane M. Malta<sup>5sup><sup> ; sup><sup>6sup><sup> ; sup><sup>24sup> ; Thais S. Sabedot<sup>5sup><sup> ; sup><sup>6sup><sup> ; sup><sup>24sup> ; Sofie R. Salama<sup>7sup> ; Bradley A. Murray<sup>8sup> ; Olena Morozova<sup>7sup> ; Yulia Newton<sup>7sup> ; Amie Radenbaugh<sup>7sup> ; Stefano M. Pagnotta<sup>2sup><sup> ; sup><sup>9sup> ; Samreen Anjum<sup>1sup> ; Jiguang Wang<sup>10sup> ; Ganiraju Manyam<sup>3sup> ; Pietro Zoppoli<sup>10sup> ; Shiyun Ling<sup>3sup> ; Arjun A. Rao<sup>7sup> ; Mia Grifford<sup>7sup> ; Andrew D. Cherniack<sup>8sup> ; Hailei Zhang<sup>8sup> ; Laila Poisson<sup>11sup> ; Carlos Gilberto Carlotti Jr.<sup>5sup><sup> ; sup><sup>6sup> ; Daniela Pretti da Cunha Tirapelli<sup>5sup><sup> ; sup><sup>6sup> ; Arvind Rao<sup>3sup> ; Tom Mikkelsen<sup>11sup> ; Ching C. Lau<sup>12sup><sup> ; sup><sup>13sup> ; W.K. Alfred Yung<sup>3sup> ; Raul Rabadan<sup>10sup> ; Jason Huse<sup>14sup> ; Daniel J. Brat<sup>15sup> ; Norman L. Lehman<sup>16sup> ; Jill S. Barnholtz-Sloan<sup>17sup> ; Siyuan Zheng<sup>3sup> ; Kenneth Hess<sup>3sup> ; Ganesh Rao<sup>3sup> ; Matthew Meyerson<sup>8sup><sup> ; sup><sup>18sup> ; Rameen Beroukhim<sup>8sup><sup> ; sup><sup>18sup><sup> ; sup><sup>19sup> ; Lee Cooper<sup>15sup> ; Rehan Akbani<sup>3sup> ; Margaret Wrensch<sup>20sup> ; David Haussler<sup>7sup> ; Kenneth D. Aldape<sup>21sup> ; Peter W. Laird<sup>22sup> ; David H. Gutmann<sup>23sup> ; TCGA Research Network ; Samreen Anjum ; Harindra Arachchi ; J. Todd Auman ; Miruna Balasundaram ; Saianand Balu ; Gene Barnett ; Stephen Baylin ; Sue Bell ; Christopher Benz ; Natalie Bir ; Keith L. Black ; Tom Bodenheimer ; Lori Boice ; Moiz S. Bootwalla ; Jay Bowen ; Christopher A. Bristow ; Yaron S.N. Butterfield ; Qing-Rong Chen ; Lynda Chin ; Juok Cho ; Eric Chuah ; Sudha Chudamani ; Simon G. Coetzee ; Mark L. Cohen ; Howard Colman ; Marta Couce ; Fulvio D&rsquo ; Angelo ; Tanja Davidsen ; Amy Davis ; John A. Demchok ; Karen Devine ; Li Ding ; Rebecca Duell ; J. Bradley Elder ; Jennifer M. Eschbacher ; Ashley Fehrenbach ; Martin Ferguson ; Scott Frazer ; Gregory Fuller ; Jordonna Fulop ; Stacey B. Gabriel ; Luciano Garofano ; Julie M. Gastier-Foster ; Nils Gehlenborg ; Mark Gerken ; Gad Getz ; Caterina Giannini ; William J. Gibson ; Angela Hadjipanayis ; D. Neil Hayes ; David I. Heiman ; Beth Hermes ; Joe Hilty ; Katherine A. Hoadley ; Alan P. Hoyle ; Mei Huang ; Stuart R. Jefferys ; Corbin D. Jones ; Steven J.M. Jones ; Zhenlin Ju ; Alison Kastl ; Ady Kendler ; Jaegil Kim ; Raju Kucherlapati ; Phillip H. Lai ; Michael S. Lawrence ; Semin Lee ; Kristen M. Leraas ; Tara M. Lichtenberg ; Pei Lin ; Yuexin Liu ; Jia Liu ; Julia Y. Ljubimova ; Yiling Lu ; Yussanne Ma ; Dennis T. Maglinte ; Harshad S. Mahadeshwar ; Marco A. Marra ; Mary McGraw ; Christopher McPherson ; Shaowu Meng ; Piotr A. Mieczkowski ; C. Ryan Miller ; Gordon B. Mills ; Richard A. Moore ; Lisle E. Mose ; Andrew J. Mungall ; Rashi Naresh ; Theresa Naska ; Luciano Neder ; Michael S. Noble ; Ardene Noss ; Brian Patrick O&rsquo ; Neill ; Quinn T. Ostrom ; Cheryl Palmer ; Angeliki Pantazi ; Michael Parfenov ; Peter J. Park ; Joel S. Parker ; Charles M. Perou ; Christopher R. Pierson ; Todd Pihl ; Alexei Protopopov ; Amie Radenbaugh ; Nilsa C. Ramirez ; W. Kimryn Rathmell ; Xiaojia Ren ; Jeffrey Roach ; A. Gordon Robertson ; Gordon Saksena ; Jacqueline E. Schein ; Steven E. Schumacher ; Jonathan Seidman ; Kelly Senecal ; Sahil Seth ; Hui Shen ; Yan Shi ; Juliann Shih ; Kristen Shimmel ; Hugues Sicotte ; Suzanne Sifri ; Tiago Silva ; Janae V. Simons ; Rosy Singh ; Tara Skelly ; Andrew E. Sloan ; Heidi J. Sofia ; Matthew G. Soloway ; Xingzhi Song ; Carrie Sougnez ; Camila Souza ; Susan M. Staugaitis ; Huandong Sun ; Charlie Sun ; Donghui Tan ; Jiabin Tang ; Yufang Tang ; Leigh Thorne ; Felipe Amstalden Trevisan ; Timothy Triche ; David J. Van Den Berg ; Umadevi Veluvolu ; Doug Voet ; Yunhu Wan ; Zhining Wang ; Ronald Warnick ; John N. Weinstein ; Daniel J. Weisenberger ; Matthew D. Wilkerson ; Felicia Williams ; Lisa Wise ; Yingli Wolinsky ; Junyuan Wu ; Andrew W. Xu ; Lixing Yang ; Liming Yang ; Travis I. Zack ; Jean C. Zenklusen ; Jianhua Zhang ; Wei Zhang ; Jiashan Zhang ; Erik Zmuda

刊名：Cell

出版年：2016

作者：Siyuan Zheng<sup>1sup> ; Andrew D. Cherniack<sup>2sup><sup> ; sup><sup>3sup> ; Ninad Dewal<sup>4sup> ; Richard A. Moffitt<sup>5sup> ; Ludmila Danilova<sup>6sup> ; Bradley A. Murray<sup>2sup><sup> ; sup><sup>3sup><sup> ; sup><sup>35sup> ; Antonio M. Lerario<sup>7sup><sup> ; sup><sup>8sup><sup> ; sup><sup>9sup> ; Tobias Else<sup>8sup><sup> ; sup><sup>9sup> ; Theo A. Knijnenburg<sup>10sup> ; Giovanni Ciriello<sup>11sup><sup> ; sup><sup>12sup> ; Seungchan Kim<sup>13sup> ; Guillaume Assie<sup>14sup><sup> ; sup><sup>15sup><sup> ; sup><sup>16sup><sup> ; sup><sup>17sup> ; Olena Morozova<sup>18sup> ; Rehan Akbani<sup>1sup> ; Juliann Shih<sup>2sup><sup> ; sup><sup>3sup> ; Katherine A. Hoadley<sup>5sup> ; Toni K. Choueiri<sup>3sup><sup> ; sup><sup>19sup> ; Jens Waldmann<sup>17sup><sup> ; sup><sup>20sup> ; Ozgur Mete<sup>21sup> ; A. Gordon Robertson<sup>22sup> ; Hsin-Ta Wu<sup>23sup> ; Benjamin J. Raphael<sup>23sup> ; Lina Shao<sup>8sup> ; Matthew Meyerson<sup>2sup><sup> ; sup><sup>3sup><sup> ; sup><sup>24sup> ; Michael J. Demeure<sup>13sup><sup> ; sup><sup>36sup> ; Felix Beuschlein<sup>17sup><sup> ; sup><sup>25sup> ; Anthony J. Gill<sup>26sup><sup> ; sup><sup>27sup> ; Stan B. Sidhu<sup>26sup><sup> ; sup><sup>28sup> ; Madson Q. Almeida<sup>7sup><sup> ; sup><sup>29sup> ; Maria C.B.V. Fragoso<sup>7sup><sup> ; sup><sup>29sup> ; Leslie M. Cope<sup>6sup> ; Electron Kebebew<sup>30sup> ; Mouhammed A. Habra<sup>1sup> ; Timothy G. Whitsett<sup>13sup> ; Kimberly J. Bussey<sup>13sup><sup> ; sup><sup>31sup> ; William E. Rainey<sup>8sup><sup> ; sup><sup>9sup> ; Sylvia L. Asa<sup>21sup> ; Jé ; rô ; me Bertherat<sup>14sup><sup> ; sup><sup>15sup><sup> ; sup><sup>16sup><sup> ; sup><sup>17sup> ; Martin Fassnacht<sup>17sup><sup> ; sup><sup>32sup><sup> ; sup><sup>33sup> ; David A. Wheeler<sup>4sup> ; The Cancer Genome Atlas Research Network ; Siyuan Zheng ; Roel G.W. Verhaak ; Thomas J. Giordano ; Gary D. Hammer ; Andrew D. Cherniack ; Ninad Dewal ; Richard A. Moffitt ; Ludmila Danilova ; Bradley A. Murray ; Antonio M. Lerario ; Tobias Else ; Theo A. Knijnenburg ; Giovanni Ciriello ; Seungchan Kim ; Guillaume Assié ; Olena Morozova ; Rehan Akbani ; Juliann Shih ; Katherine A. Hoadley ; Toni K. Choueiri ; Jens Waldmann ; Ozgur Mete ; A. Gordon Robertson ; Hsin-Tu Wu ; Benjamin J. Raphael ; Matthew Meyerson ; Michael J. Demeure ; Felix Beuschlein ; Anthony J. Gill ; Stan B. Sidhu ; Madson Almeida ; Maria Candida Barisson Fragoso ; Leslie M. Cope ; Electron Kebebew ; Mouhammed Amir Habra ; Timothy G. Whitsett ; Kimberly J. Bussey ; William E. Rainey ; Sylvia L. Asa ; Jé ; rô ; me Bertherat ; Martin Fassnacht ; David A. Wheeler ; Christopher Benz ; Adrian Ally ; Miruna Balasundaram ; Reanne Bowlby ; Denise Brooks ; Yaron S.N. Butterfield ; Rebecca Carlsen ; Noreen Dhalla ; Ranabir Guin ; Robert A. Holt ; Steven J.M. Jones ; Katayoon Kasaian ; Darlene Lee ; Haiyan I. Li ; Lynette Lim ; Yussanne Ma ; Marco A. Marra ; Michael Mayo ; Richard A. Moore ; Andrew J. Mungall ; Karen Mungall ; Sara Sadeghi ; Jacqueline E. Schein ; Payal Sipahimalani ; Angela Tam ; Nina Thiessen ; Peter J. Park ; Matthias Kroiss ; Jianjiong Gao ; Chris Sander ; Nikolaus Schultz ; Corbin D. Jones ; Raju Kucherlapati ; Piotr A. Mieczkowski ; Joel S. Parker ; Charles M. Perou ; Donghui Tan ; Umadevi Veluvolu ; Matthew D. Wilkerson ; D. Neil Hayes ; Marc Ladanyi ; Marcus Quinkler ; J. Todd Auman ; Ana Claudia Latronico ; Berenice B. Mendonca ; Mathilde Sibony ; Zack Sanborn ; Michelle Bellair ; Christian Buhay ; Kyle Covington ; Mahmoud Dahdouli ; Huyen Dinh ; Harsha Doddapaneni ; Brittany Downs ; Jennifer Drummond ; Richard Gibbs ; Walker Hale ; Yi Han ; Alicia Hawes ; Jianhong Hu ; Nipun Kakkar ; Divya Kalra ; Ziad Khan ; Christine Kovar ; Sandy Lee ; Lora Lewis ; Margaret Morgan ; Donna Morton ; Donna Muzny ; Jireh Santibanez ; Liu Xi ; Bertrand Dousset ; Lionel Groussin ; Rossella Libé ; Lynda Chin ; Sheila Reynolds ; Ilya Shmulevich ; Sudha Chudamani ; Jia Liu ; Laxmi Lolla ; Ye Wu ; Jen Jen Yeh ; Saianand Balu ; Tom Bodenheimer ; Alan P. Hoyle ; Stuart R. Jefferys ; Shaowu Meng ; Lisle E. Mose ; Yan Shi ; Janae V. Simons ; Matthew G. Soloway ; Junyuan Wu ; Wei Zhang ; Kenna R. Mills Shaw ; John A. Demchok ; Ina Felau ; Margi Sheth ; Roy Tarnuzzer ; Zhining Wang ; Liming Yang ; Jean C. Zenklusen ; Jiashan (Julia) Zhang ; Tanja Davidsen ; Catherine Crawford ; Carolyn M. Hutter ; Heidi J. Sofia ; Jeffrey Roach ; Wiam Bshara ; Carmelo Gaudioso ; Carl Morrison ; Patsy Soon ; Shelley Alonso ; Julien Baboud ; Todd Pihl ; Rohini Raman ; Qiang Sun ; Yunhu Wan ; Rashi Naresh ; Harindra Arachchi ; Rameen Beroukhim ; Scott L. Carter ; Juok Cho ; Scott Frazer ; Stacey B. Gabriel ; Gad Getz ; David I. Heiman ; Jaegil Kim ; Michael S. Lawrence ; Pei Lin ; Michael S. Noble ; Gordon Saksena ; Steven E. Schumacher ; Carrie Sougnez ; Doug Voet ; Hailei Zhang ; Jay Bowen ; Sara Coppens ; Julie M. Gastier-Foster ; Mark Gerken ; Carmen Helsel ; Kristen M. Leraas ; Tara M. Lichtenberg ; Nilsa C. Ramirez ; Lisa Wise ; Erik Zmuda ; Stephen Baylin ; James G. Herman ; Janine LoBello ; Aprill Watanabe ; David Haussler ; Amie Radenbaugh ; Arjun Rao ; Jingchun Zhu ; Detlef K. Bartsch ; Silviu Sbiera ; Bruno Allolio ; Timo Deutschbein ; Cristina Ronchi ; Victoria M. Raymond ; Michelle Vinco ; Lina Shao ; Linda Amble ; Moiz S. Bootwalla ; Phillip H. Lai ; David J. Van Den Berg ; Daniel J. Weisenberger ; Bruce Robinson ; Zhenlin Ju ; Hoon Kim ; Shiyun Ling ; Wenbin Liu ; Yiling Lu ; Gordon B. Mills ; Kanishka Sircar ; Qianghu Wang ; Kosuke Yoshihara ; Peter W. Laird ; Yu Fan ; Wenyi Wang ; Eve Shinbrot ; Martin Reincke ; John N. Weinstein ; Sam Meier ; Timothy Defreitas

刊名：Cancer Cell

出版年：2016

作者：The Cancer Genome Atlas Research Network<sup>1sup> ; <sup> ; sup><sup>schultz@cbio.mskcc.org" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding authorsup><sup> ; sup><sup>massimo_loda@dfci.harvard.edu" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding authorsup><sup> ; sup><sup>sander.research@gmail.com" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding authorsup>Adam Abeshouse ; Jaeil Ahn ; Rehan Akbani ; Adrian Ally ; Samirkumar Amin ; Christopher D. Andry ; Matti Annala ; Armen Aprikian ; Joshua Armenia ; Arshi Arora ; J. Todd Auman ; Miruna Balasundaram ; Saianand Balu ; Christopher E. Barbieri ; Thomas Bauer ; Christopher C. Benz ; Alain Bergeron ; Rameen Beroukhim ; Mario Berrios ; Adrian Bivol ; Tom Bodenheimer ; Lori Boice ; Moiz S. Bootwalla ; Rodolfo Borges dos Reis ; Paul C. Boutros ; Jay Bowen ; Reanne Bowlby ; Jeffrey Boyd ; Robert K. Bradley ; Anne Breggia ; Fadi Brimo ; Christopher A. Bristow ; Denise Brooks ; Bradley M. Broom ; Alan H. Bryce ; Glenn Bubley ; Eric Burks ; Yaron S.N. Butterfield ; Michael Button ; David Canes ; Carlos G. Carlotti ; Rebecca Carlsen ; Michel Carmel ; Peter R. Carroll ; Scott L. Carter ; Richard Cartun ; Brett S. Carver ; June M. Chan ; Matthew T. Chang ; Yu Chen ; Andrew D. Cherniack ; Simone Chevalier ; Lynda Chin ; Juok Cho ; Andy Chu ; Eric Chuah ; Sudha Chudamani ; Kristian Cibulskis ; Giovanni Ciriello ; Amanda Clarke ; Matthew R. Cooperberg ; Niall M. Corcoran ; Anthony J. Costello ; Janet Cowan ; Daniel Crain ; Erin Curley ; Kerstin David ; John A. Demchok ; Francesca Demichelis ; Noreen Dhalla ; Rajiv Dhir ; Alexandre Doueik ; Bettina Drake ; Heidi Dvinge ; Natalya Dyakova ; Ina Felau ; Martin L. Ferguson ; Scott Frazer ; Stephen Freedland ; Yao Fu ; Stacey B. Gabriel ; Jianjiong Gao ; Johanna Gardner ; Julie M. Gastier-Foster ; Nils Gehlenborg ; Mark Gerken ; Mark B. Gerstein ; Gad Getz ; Andrew K. Godwin ; Anuradha Gopalan ; Markus Graefen ; Kiley Graim ; Thomas Gribbin ; Ranabir Guin ; Manaswi Gupta ; Angela Hadjipanayis ; Syed Haider ; Lucie Hamel ; D. Neil Hayes ; David I. Heiman ; Julian Hess ; Katherine A. Hoadley ; Andrea H. Holbrook ; Robert A. Holt ; Antonia Holway ; Christopher M. Hovens ; Alan P. Hoyle ; Mei Huang ; Carolyn M. Hutter ; Michael Ittmann ; Lisa Iype ; Stuart R. Jefferys ; Corbin D. Jones ; Steven J.M. Jones ; Hartmut Juhl ; Andre Kahles ; Christopher J. Kane ; Katayoon Kasaian ; Michael Kerger ; Ekta Khurana ; Jaegil Kim ; Robert J. Klein ; Raju Kucherlapati ; Louis Lacombe ; Marc Ladanyi ; Phillip H. Lai ; Peter W. Laird ; Eric S. Lander ; Mathieu Latour ; Michael S. Lawrence ; Kevin Lau ; Tucker LeBien ; Darlene Lee ; Semin Lee ; Kjong-Van Lehmann ; Kristen M. Leraas ; Ignaty Leshchiner ; Robert Leung ; John A. Libertino ; Tara M. Lichtenberg ; Pei Lin ; W. Marston Linehan ; Shiyun Ling ; Scott M. Lippman ; Jia Liu ; Wenbin Liu ; Lucas Lochovsky ; Massimo Loda ; Christopher Logothetis ; Laxmi Lolla ; Teri Longacre ; Yiling Lu ; Jianhua Luo ; Yussanne Ma ; Harshad S. Mahadeshwar ; David Mallery ; Armaz Mariamidze ; Marco A. Marra ; Michael Mayo ; Shannon McCall ; Ginette McKercher ; Shaowu Meng ; Anne-Marie Mes-Masson ; Maria J. Merino ; Matthew Meyerson ; Piotr A. Mieczkowski ; Gordon B. Mills ; Kenna R. Mills Shaw ; Sarah Minner ; Alireza Moinzadeh ; Richard A. Moore ; Scott Morris ; Carl Morrison ; Lisle E. Mose ; Andrew J. Mungall ; Bradley A. Murray ; Jerome B. Myers ; Rashi Naresh ; Joel Nelson ; Mark A. Nelson ; Peter S. Nelson ; Yulia Newton ; Michael S. Noble ; Houtan Noushmehr ; Matti Nykter ; Angeliki Pantazi ; Michael Parfenov ; Peter J. Park ; Joel S. Parker ; Joseph Paulauskis ; Robert Penny ; Charles M. Perou ; Alain Piché ; Todd Pihl ; Peter A. Pinto ; Davide Prandi ; Alexei Protopopov ; Nilsa C. Ramirez ; Arvind Rao ; W. Kimryn Rathmell ; Gunnar Rä ; tsch ; Xiaojia Ren ; Victor E. Reuter ; Sheila M. Reynolds ; Suhn K. Rhie ; Kimberly Rieger-Christ ; Jeffrey Roach ; A. Gordon Robertson ; Brian Robinson ; Mark A. Rubin ; Fred Saad ; Sara Sadeghi ; Gordon Saksena ; Charles Saller ; Andrew Salner ; Francisco Sanchez-Vega ; Chris Sander ; George Sandusky ; Guido Sauter ; Andrea Sboner ; Peter T. Scardino ; Eleonora Scarlata ; Jacqueline E. Schein ; Thorsten Schlomm ; Laura S. Schmidt ; Nikolaus Schultz ; Steven E. Schumacher ; Jonathan Seidman ; Luciano Neder ; Sahil Seth ; Alexis Sharp ; Candace Shelton ; Troy Shelton ; Hui Shen ; Ronglai Shen ; Mark Sherman ; Margi Sheth ; Yan Shi ; Juliann Shih ; Ilya Shmulevich ; Jeffry Simko ; Ronald Simon ; Janae V. Simons ; Payal Sipahimalani ; Tara Skelly ; Heidi J. Sofia ; Matthew G. Soloway ; Xingzhi Song ; Andrea Sorcini ; Carrie Sougnez ; Serghei Stepa ; Chip Stewart ; John Stewart ; Joshua M. Stuart ; Travis B. Sullivan ; Charlie Sun ; Huandong Sun ; Angela Tam ; Donghui Tan ; Jiabin Tang ; Roy Tarnuzzer ; Katherine Tarvin ; Barry S. Taylor ; Patrick Teebagy ; Imelda Tenggara ; Bernard Tê ; tu ; Ashutosh Tewari ; Nina Thiessen ; Timothy Thompson ; Leigh B. Thorne ; Daniela P. Tirapelli ; Scott A. Tomlins ; Felipe Amstalden Trevisan ; Patricia Troncoso ; Lawrence D. True ; Maria Christina Tsourlakis ; Svitlana Tyekucheva ; Eliezer Van Allen ; David J. Van Den Berg ; Umadevi Veluvolu ; Roel Verhaak ; Cathy D. Vocke ; Doug Voet ; Yunhu Wan ; Qingguo Wang ; Wenyi Wang ; Zhining Wang ; Nils Weinhold ; John N. Weinstein ; Daniel J. Weisenberger ; Matthew D. Wilkerson ; Lisa Wise ; John Witte ; Chia-Chin Wu ; Junyuan Wu ; Ye Wu ; Andrew W. Xu ; Shalini S. Yadav ; Liming Yang ; Lixing Yang ; Christina Yau ; Huihui Ye ; Peggy Yena ; Thomas Zeng ; Jean C. Zenklusen ; Hailei Zhang ; Jianhua Zhang ; Jiashan Zhang ; Wei Zhang ; Yi Zhong ; Kelsey Zhu ; Erik Zmuda

刊名：Cell

出版年：2015

作者：Seema  ; Yalamanchili ; Julian  ; Rycroft ; Yaron  ; Berkowitz ; Martin  ; Hossack ; Nick  ; Butterfield ; Duncan  ; Rogers ; Jonathan  ; White ; Robin  ; Smith

刊名：Journal of Infection

出版年：2011

作者：Guus Bakkeren ; Guoqiao Jiang ; René ; L. Warren ; Yaron Butterfield ; Heesun Shin ; Readman Chiu ; Rob Linning ; Jacqueline Schein ; Nancy Lee ; Guanggan Hu et al.

关键词：BAC mapping ; MAT locus ; Retrotransposons ; rRNA unit ; Sex chromosome ; Ustilago hordei

刊名：Fungal Genetics and Biology

出版年：2006